26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0755 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0755  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 123 aa  248  2e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1972  DNA polymerase beta domain protein region  51.43 
 
 		 131 aa  76.6  0.00000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.18731 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1816  hypothetical protein  50 
 
 		 133 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000972669  normal  0.858588 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2973  DNA polymerase beta subunit  45.78 
 
 		 132 aa  70.9  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1471  DNA polymerase beta domain protein region  44.87 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.764189  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0766  DNA polymerase beta subunit  43.53 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0331  hypothetical protein  36.08 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0231643  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2332  DNA polymerase beta subunit  42.35 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1589  DNA polymerase beta domain protein region  42.31 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.382693  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1999  DNA polymerase beta domain protein region  45 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.95495  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0133  DNA polymerase beta subunit  44.93 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2946  DNA polymerase beta subunit  42.47 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0658  DNA polymerase beta subunit  33.75 
 
 		 137 aa  47.8  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311195  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1276  DNA polymerase beta subunit  36.17 
 
 		 129 aa  47.4  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000156571 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1075  DNA polymerase beta subunit  33.96 
 
 		 132 aa  47  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141135 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2345  DNA polymerase beta domain protein region  27.78 
 
 		 144 aa  46.2  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3165  hypothetical protein  39.06 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4528  DNA polymerase beta subunit  39.73 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.373361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1762  nucleotidyltransferase family protein  50 
 
 		 97 aa  44.3  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.324196 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2244  DNA polymerase beta subunit  35.9 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.521292  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3505  DNA polymerase beta subunit  40 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1223  DNA polymerase beta domain protein region  38.24 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3257  DNA polymerase, beta-like region  31.25 
 
 		 132 aa  41.6  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00329127  hitchhiker  2.42256e-16 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1760  DNA polymerase beta domain protein region  34.52 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0929  DNA polymerase beta domain protein region  37.14 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.887181  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3941  DNA polymerase beta domain protein region  35.71 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>