59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1471 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1471  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 139 aa  279  9e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.764189  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0766  DNA polymerase beta subunit  89.21 
 
 		 139 aa  249  9.000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1589  DNA polymerase beta domain protein region  83.33 
 
 		 132 aa  223  9e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.382693  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0331  hypothetical protein  70.23 
 
 		 134 aa  185  1e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0231643  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1972  DNA polymerase beta domain protein region  56.59 
 
 		 131 aa  150  5e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.18731 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2332  DNA polymerase beta subunit  55.74 
 
 		 128 aa  144  5e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1816  hypothetical protein  51.94 
 
 		 133 aa  139  9.999999999999999e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000972669  normal  0.858588 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2973  DNA polymerase beta subunit  49.17 
 
 		 132 aa  116  7.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3253  DNA polymerase beta domain protein region  39.68 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0755  DNA polymerase beta subunit  44.87 
 
 		 123 aa  63.2  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3015  DNA polymerase beta subunit  41.67 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.914629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2422  DNA polymerase beta subunit  37.5 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1999  DNA polymerase beta domain protein region  40.28 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.95495  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2345  DNA polymerase beta domain protein region  35.63 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3165  hypothetical protein  38.96 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1075  DNA polymerase beta subunit  41.86 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141135 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  37.04 
 
 		 271 aa  52.4  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3505  DNA polymerase beta subunit  35.64 
 
 		 115 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1760  DNA polymerase beta domain protein region  39.71 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5679  putative nucleotidyltransferase  37.84 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0666104  decreased coverage  0.000482275 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0269  nucleotidyltransferase  37.84 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1252  DNA polymerase beta subunit  33.65 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1672  DNA polymerase beta domain protein region  32.18 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2244  DNA polymerase beta subunit  29.6 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.521292  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3353  DNA polymerase beta subunit  36.46 
 
 		 112 aa  47.4  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0133  DNA polymerase beta subunit  46.27 
 
 		 131 aa  47.4  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4528  DNA polymerase beta subunit  41.18 
 
 		 152 aa  47  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.373361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0829  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 98 aa  47  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.141069  normal  0.412533 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3654  hypothetical protein  38.66 
 
 		 137 aa  47  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.544333  normal  0.731043 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1762  nucleotidyltransferase family protein  38.16 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.324196 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3592  DNA polymerase beta domain protein region  38.89 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000372185  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0929  DNA polymerase beta domain protein region  35.53 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.887181  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1668  DNA polymerase beta domain protein region  28.46 
 
 		 146 aa  44.7  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2165  DNA polymerase beta subunit  28.57 
 
 		 151 aa  43.9  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2281  nucleotidyltransferase  37.31 
 
 		 132 aa  43.9  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0106509  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02490  nucleotidyltransferase  40.74 
 
 		 103 aa  43.9  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.456196  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2954  DNA polymerase beta subunit  30.53 
 
 		 133 aa  43.5  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0551  DNA polymerase beta domain protein region  37.78 
 
 		 106 aa  43.5  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1277  DNA polymerase beta subunit  31.25 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.288341  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0703  DNA polymerase beta domain protein region  42 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000025763  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0658  DNA polymerase beta subunit  36.36 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311195  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1276  DNA polymerase beta subunit  39.71 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000156571 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0028  nucleotidyltransferase family protein  39.19 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.422617  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0095  DNA polymerase beta subunit  35.16 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.365343 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3044  hypothetical protein  33.33 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.137112  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0244  DNA polymerase beta domain protein region  34.94 
 
 		 131 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2946  DNA polymerase beta subunit  39.73 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0825  DNA polymerase beta subunit  26.19 
 
 		 140 aa  41.2  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.453012  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5818  DNA polymerase beta domain protein region  40.32 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0763  DNA polymerase beta subunit  29.06 
 
 		 143 aa  40.8  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.122769 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3257  DNA polymerase, beta-like region  34.57 
 
 		 132 aa  40.8  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00329127  hitchhiker  2.42256e-16 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0250  DNA polymerase beta subunit  35.56 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3676  DNA polymerase beta domain protein region  41.94 
 
 		 132 aa  40.8  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.839378  normal  0.137366 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2563  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 133 aa  40.8  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3010  restriction modification system DNA specificity subunit  32.56 
 
 		 549 aa  40.8  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.340841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1475  DNA polymerase beta domain protein region  45.83 
 
 		 100 aa  40.4  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4067  DNA polymerase beta domain protein region  30.43 
 
 		 110 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0548  nucleotidyltransferase family protein  39.68 
 
 		 93 aa  40.4  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4418  DNA polymerase beta subunit  29.06 
 
 		 148 aa  40  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234666 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>