64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3015 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3015  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 142 aa  288  2e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.914629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4528  DNA polymerase beta subunit  66.92 
 
 		 152 aa  179  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.373361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1999  DNA polymerase beta domain protein region  49.62 
 
 		 155 aa  124  6e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.95495  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2352  DNA polymerase, beta-like region  33.57 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00951181  normal  0.0970434 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1668  DNA polymerase beta domain protein region  34.51 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1816  hypothetical protein  43.66 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000972669  normal  0.858588 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1672  DNA polymerase beta domain protein region  30.77 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2195  DNA polymerase beta domain protein region  34.51 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000295232  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1972  DNA polymerase beta domain protein region  31.25 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.18731 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  32.43 
 
 		 271 aa  58.9  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1471  DNA polymerase beta domain protein region  41.67 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.764189  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1589  DNA polymerase beta domain protein region  40.23 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.382693  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0766  DNA polymerase beta subunit  40.7 
 
 		 139 aa  57  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2244  DNA polymerase beta subunit  29.31 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.521292  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0250  DNA polymerase beta subunit  40.82 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2954  DNA polymerase beta subunit  30.3 
 
 		 133 aa  53.5  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0209  hypothetical protein  33.08 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.184699  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0372  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000034054  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0074  DNA polymerase beta subunit  33.94 
 
 		 167 aa  51.2  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.649799  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0244  DNA polymerase beta domain protein region  38.96 
 
 		 131 aa  50.8  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1370  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 241 aa  50.8  0.000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0334218 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2973  DNA polymerase beta subunit  34.38 
 
 		 132 aa  50.8  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1692  DNA polymerase beta subunit  34.07 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000104871  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1563  DNA polymerase beta domain protein region  29.41 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0007  DNA polymerase beta subunit  41.33 
 
 		 209 aa  48.5  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0178  DNA polymerase, beta-like region  38 
 
 		 163 aa  48.5  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0107452  normal  0.933077 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1105  DNA polymerase beta subunit  32.74 
 
 		 162 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00137564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1252  DNA polymerase beta subunit  39.47 
 
 		 147 aa  47.4  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2332  DNA polymerase beta subunit  37.66 
 
 		 128 aa  47.4  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0428  DNA polymerase, beta-like region  29.41 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0480568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0364  DNA polymerase beta subunit  29.71 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0409  DNA polymerase beta subunit  38.24 
 
 		 96 aa  45.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1422  DNA polymerase beta subunit  30.25 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.747879  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0603  hypothetical protein  32.91 
 
 		 104 aa  46.2  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3654  hypothetical protein  30 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.544333  normal  0.731043 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0331  hypothetical protein  36.05 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0231643  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3260  transcriptional regulator, XRE family  42.42 
 
 		 152 aa  45.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1438  DNA polymerase beta subunit  31.11 
 
 		 129 aa  44.7  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000026658  hitchhiker  0.0000058254 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1678  DNA polymerase beta subunit  32.54 
 
 		 153 aa  44.7  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000143849  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2165  DNA polymerase beta subunit  26.27 
 
 		 151 aa  44.7  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2462  DNA polymerase beta subunit  41.33 
 
 		 98 aa  44.7  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.266656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0658  DNA polymerase beta subunit  33.04 
 
 		 137 aa  44.3  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311195  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1410  paREP11  39.73 
 
 		 172 aa  44.3  0.0006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.345052  normal  0.266454 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0882  DNA polymerase beta subunit  29.46 
 
 		 156 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0225  DNA polymerase beta domain protein region  32.71 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3253  DNA polymerase beta domain protein region  36.11 
 
 		 132 aa  43.9  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1588  hypothetical protein  27.41 
 
 		 146 aa  43.9  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3062  DNA polymerase beta domain protein region  37.5 
 
 		 189 aa  43.5  0.0009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1861  DNA polymerase beta subunit  32.09 
 
 		 140 aa  42.7  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1769  hypothetical protein  26.45 
 
 		 292 aa  43.5  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.026632  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0806  nucleotidyltransferase substrate binding protein, HI0074 family  36.25 
 
 		 247 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1241  DNA polymerase beta domain-containing protein region  31.43 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.282265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1772  DNA polymerase beta domain protein region  33.82 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1691  DNA polymerase beta domain protein region  38.3 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0339005 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2495  DNA polymerase beta domain protein region  40.68 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0548  nucleotidyltransferase family protein  43.75 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3147  DNA polymerase beta domain protein region  36.56 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.949814 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0703  DNA polymerase beta domain protein region  32.1 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000025763  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0949  DNA polymerase beta subunit  35.44 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.878884  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1188  DNA polymerase beta domain protein region  31.76 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3203  DNA polymerase beta subunit  36 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4099  hypothetical protein  25.66 
 
 		 129 aa  40.8  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.41555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1475  DNA polymerase beta domain protein region  47.37 
 
 		 100 aa  40.4  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3257  DNA polymerase, beta-like region  28.46 
 
 		 132 aa  40  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00329127  hitchhiker  2.42256e-16 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>