61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0225 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_0225  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 
142 aa  282  1.0000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1672  DNA polymerase beta domain protein region  33.82 
 
 
146 aa  71.6  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2352  DNA polymerase, beta-like region  33.86 
 
 
148 aa  68.9  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00951181  normal  0.0970434 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2244  DNA polymerase beta subunit  39.25 
 
 
146 aa  67.8  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.521292  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2195  DNA polymerase beta domain protein region  36.28 
 
 
145 aa  66.6  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000295232  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1370  DNA polymerase beta subunit  36.19 
 
 
241 aa  60.5  0.000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0334218 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1668  DNA polymerase beta domain protein region  29.66 
 
 
146 aa  58.5  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0178  DNA polymerase, beta-like region  41 
 
 
163 aa  58.2  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0107452  normal  0.933077 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0769  DNA polymerase beta subunit  31.48 
 
 
140 aa  57.4  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  33.06 
 
 
271 aa  57.4  0.00000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4528  DNA polymerase beta subunit  37.1 
 
 
152 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.373361  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0074  DNA polymerase beta subunit  36.07 
 
 
167 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.649799  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2563  DNA polymerase beta domain protein region  37.96 
 
 
133 aa  55.5  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0250  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 
137 aa  55.1  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2558  DNA polymerase beta domain protein region  39.45 
 
 
157 aa  54.7  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4418  DNA polymerase beta subunit  28.47 
 
 
148 aa  54.3  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.234666 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0658  DNA polymerase beta subunit  35.71 
 
 
137 aa  53.5  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311195  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3257  DNA polymerase, beta-like region  35.42 
 
 
132 aa  52.4  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00329127  hitchhiker  2.42256e-16 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2567  DNA polymerase beta domain protein region  24.24 
 
 
141 aa  52  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1422  DNA polymerase beta subunit  33.01 
 
 
123 aa  51.2  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.747879  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0244  DNA polymerase beta domain protein region  36.47 
 
 
131 aa  51.2  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2978  DNA polymerase beta domain protein region  34.94 
 
 
217 aa  50.4  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2973  DNA polymerase beta subunit  34.75 
 
 
132 aa  50.1  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1105  DNA polymerase beta subunit  31.67 
 
 
162 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00137564  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1075  DNA polymerase beta subunit  31.53 
 
 
132 aa  49.7  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.141135 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1316  nucleotidyltransferase  32 
 
 
148 aa  50.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0763  DNA polymerase beta subunit  28.46 
 
 
143 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.122769 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0825  DNA polymerase beta subunit  29.46 
 
 
140 aa  49.3  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.453012  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3165  hypothetical protein  28.87 
 
 
139 aa  48.9  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0209  hypothetical protein  31.73 
 
 
142 aa  48.1  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.184699  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2345  DNA polymerase beta domain protein region  30.19 
 
 
144 aa  48.5  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0551  DNA polymerase beta domain protein region  37.5 
 
 
106 aa  48.5  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0304  DNA polymerase beta subunit  37.25 
 
 
116 aa  46.6  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1064  hypothetical protein  42.86 
 
 
53 aa  46.2  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.162255  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1252  DNA polymerase beta domain protein region  32.05 
 
 
136 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.859255 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1397  DNA polymerase beta domain protein region  34.12 
 
 
134 aa  45.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0347326  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0929  DNA polymerase beta domain protein region  38.89 
 
 
96 aa  45.4  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.887181  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2281  nucleotidyltransferase  32.26 
 
 
132 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0106509  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0323  DNA polymerase beta subunit  30.77 
 
 
116 aa  45.1  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.103671  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1113  DNA polymerase beta subunit  29.13 
 
 
109 aa  44.7  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3015  DNA polymerase beta subunit  32.71 
 
 
142 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.914629  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0372  DNA polymerase beta subunit  35.45 
 
 
141 aa  43.9  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000034054  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3062  DNA polymerase beta domain protein region  36.99 
 
 
189 aa  43.9  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0758  DNA polymerase beta subunit  27.45 
 
 
136 aa  43.9  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.258998  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5679  putative nucleotidyltransferase  31.13 
 
 
135 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0666104  decreased coverage  0.000482275 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0760  DNA polymerase beta subunit  29.77 
 
 
133 aa  43.5  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0261005  normal  0.995846 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0172  nucleotidyltransferase  30.69 
 
 
109 aa  43.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.778206  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0545  DNA polymerase beta domain protein region  31.58 
 
 
135 aa  42.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00116753  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1313  hypothetical protein  29.46 
 
 
133 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0364  DNA polymerase beta subunit  25.64 
 
 
148 aa  42.4  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2954  DNA polymerase beta subunit  28.3 
 
 
133 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1678  DNA polymerase beta subunit  26.67 
 
 
153 aa  41.6  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000143849  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1861  DNA polymerase beta subunit  26.32 
 
 
140 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1655  DNA polymerase beta domain protein region  36.73 
 
 
128 aa  40.8  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1999  DNA polymerase beta domain protein region  28.23 
 
 
155 aa  40.8  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.95495  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0269  nucleotidyltransferase  29.25 
 
 
135 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2535  DNA polymerase, beta-like region  31.68 
 
 
116 aa  40.4  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000686331  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0185  DNA polymerase, beta-like region  30.39 
 
 
150 aa  40.4  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.519951 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1760  DNA polymerase beta domain protein region  31.91 
 
 
135 aa  40.4  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0133  DNA polymerase beta subunit  34.04 
 
 
131 aa  40.4  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1276  DNA polymerase beta subunit  31.96 
 
 
129 aa  40.4  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000156571 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>