143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1736 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  100 
 
 		 271 aa  535  1e-151  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0250  DNA polymerase beta subunit  42.02 
 
 		 137 aa  93.2  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1370  DNA polymerase beta subunit  33.8 
 
 		 241 aa  91.3  1e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0334218 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0224  protein of unknown function DUF86  35.54 
 
 		 130 aa  85.1  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2195  DNA polymerase beta domain protein region  36.96 
 
 		 145 aa  82.4  0.000000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000295232  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1410  paREP11  39.64 
 
 		 172 aa  81.6  0.00000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.345052  normal  0.266454 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2562  protein of unknown function DUF86  36.29 
 
 		 138 aa  78.6  0.00000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1999  DNA polymerase beta domain protein region  41.28 
 
 		 155 aa  75.1  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.95495  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1422  DNA polymerase beta subunit  40 
 
 		 123 aa  73.9  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.747879  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1668  DNA polymerase beta domain protein region  40 
 
 		 146 aa  74.3  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2352  DNA polymerase, beta-like region  36.13 
 
 		 148 aa  71.2  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00951181  normal  0.0970434 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0658  DNA polymerase beta subunit  32.43 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311195  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1588  hypothetical protein  34.51 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2281  nucleotidyltransferase  37.38 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0106509  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0762  hypothetical protein  31.25 
 
 		 137 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.120748 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0074  DNA polymerase beta subunit  34.71 
 
 		 167 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.649799  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0769  DNA polymerase beta subunit  37.5 
 
 		 140 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0882  DNA polymerase beta subunit  32.56 
 
 		 156 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3257  DNA polymerase, beta-like region  29.73 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00329127  hitchhiker  2.42256e-16 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1900  hypothetical protein  30.89 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0372  DNA polymerase beta subunit  32.5 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000034054  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1563  DNA polymerase beta domain protein region  38.18 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2567  DNA polymerase beta domain protein region  29.46 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0178  DNA polymerase, beta-like region  33.93 
 
 		 163 aa  65.9  0.0000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0107452  normal  0.933077 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1760  DNA polymerase beta domain protein region  41.11 
 
 		 135 aa  65.5  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1105  DNA polymerase beta subunit  38.6 
 
 		 162 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00137564  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1672  DNA polymerase beta domain protein region  41.3 
 
 		 146 aa  65.1  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0209  hypothetical protein  32.31 
 
 		 142 aa  64.3  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.184699  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0770  hypothetical protein  34.48 
 
 		 143 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465688 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4417  hypothetical protein  29.77 
 
 		 137 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.126362 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0245  protein of unknown function DUF86  32.37 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2243  hypothetical protein  32.67 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.125397  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3046  protein of unknown function DUF86  39.51 
 
 		 145 aa  61.6  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0185  DNA polymerase, beta-like region  29.03 
 
 		 150 aa  60.8  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.519951 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4528  DNA polymerase beta subunit  33.96 
 
 		 152 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.373361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0545  DNA polymerase beta domain protein region  31.53 
 
 		 135 aa  60.5  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00116753  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0364  DNA polymerase beta subunit  31.09 
 
 		 148 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2733  protein of unknown function DUF86  35.2 
 
 		 138 aa  60.5  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.226128  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3253  DNA polymerase beta domain protein region  33.64 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3015  DNA polymerase beta subunit  32.43 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.914629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3258  hypothetical protein  32.56 
 
 		 139 aa  58.5  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115451  hitchhiker  2.57897e-16 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2344  protein of unknown function DUF86  34.52 
 
 		 140 aa  57.4  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2422  DNA polymerase beta subunit  31.07 
 
 		 135 aa  57.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0225  DNA polymerase beta domain protein region  33.06 
 
 		 142 aa  57.4  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2244  DNA polymerase beta subunit  31.07 
 
 		 146 aa  57  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.521292  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2901  protein of unknown function DUF86  36.36 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4000  DNA polymerase beta domain protein region  30.17 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2194  protein of unknown function DUF86  30.25 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000224954  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0270  hypothetical protein  37.35 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4418  DNA polymerase beta subunit  27.5 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234666 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2946  DNA polymerase beta subunit  30.83 
 
 		 131 aa  54.7  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0133  DNA polymerase beta subunit  34.34 
 
 		 131 aa  55.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0128  protein of unknown function DUF86  32.35 
 
 		 140 aa  55.5  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00082454  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1082  hypothetical protein  32 
 
 		 256 aa  55.1  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.167925  normal  0.321857 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1074  hypothetical protein  37.5 
 
 		 143 aa  54.3  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.673636  normal  0.243145 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1075  DNA polymerase beta subunit  29.52 
 
 		 132 aa  54.3  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141135 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0825  DNA polymerase beta subunit  31.58 
 
 		 140 aa  53.9  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.453012  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2954  DNA polymerase beta subunit  31.19 
 
 		 133 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1276  DNA polymerase beta subunit  43.28 
 
 		 129 aa  53.9  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000156571 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2568  protein of unknown function DUF86  28.04 
 
 		 140 aa  53.9  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0179  hypothetical protein  31.36 
 
 		 128 aa  53.1  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00352921  normal  0.908992 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0134  hypothetical protein  37.5 
 
 		 142 aa  53.1  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1692  DNA polymerase beta subunit  37.11 
 
 		 139 aa  52.8  0.000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000104871  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2977  protein of unknown function DUF86  31.07 
 
 		 140 aa  52.8  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1275  hypothetical protein  37.97 
 
 		 140 aa  52.8  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000365533 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4529  hypothetical protein  29.46 
 
 		 132 aa  52.8  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.249791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1471  DNA polymerase beta domain protein region  37.04 
 
 		 139 aa  52.4  0.000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.764189  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0073  hypothetical protein  31.13 
 
 		 112 aa  52.4  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.483504  normal  0.176783 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5680  hypothetical protein  34.52 
 
 		 137 aa  52.4  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0684551  hitchhiker  0.00143143 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2558  DNA polymerase beta domain protein region  38.61 
 
 		 157 aa  52.4  0.000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2973  DNA polymerase beta subunit  37.08 
 
 		 132 aa  51.6  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1113  DNA polymerase beta subunit  38.46 
 
 		 109 aa  52  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0763  DNA polymerase beta subunit  27.43 
 
 		 143 aa  52  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.122769 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5679  putative nucleotidyltransferase  32.32 
 
 		 135 aa  52  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0666104  decreased coverage  0.000482275 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2563  DNA polymerase beta domain protein region  35.34 
 
 		 133 aa  52  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2345  DNA polymerase beta domain protein region  31.82 
 
 		 144 aa  51.2  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1972  DNA polymerase beta domain protein region  32.97 
 
 		 131 aa  50.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.18731 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1470  protein of unknown function DUF86  27.52 
 
 		 139 aa  51.2  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.35466  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2947  hypothetical protein  38.96 
 
 		 140 aa  51.2  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0172  nucleotidyltransferase  33.02 
 
 		 109 aa  51.2  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.778206  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1251  protein of unknown function DUF86  30.1 
 
 		 141 aa  51.2  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.414648 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1667  protein of unknown function DUF86  29.73 
 
 		 139 aa  51.2  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0894  hypothetical protein  38.36 
 
 		 139 aa  50.4  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0527  protein of unknown function DUF86  26.79 
 
 		 133 aa  50.1  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0767  hypothetical protein  27.69 
 
 		 139 aa  50.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0768  hypothetical protein  27.69 
 
 		 139 aa  50.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3016  hypothetical protein  33.33 
 
 		 131 aa  49.3  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0244  DNA polymerase beta domain protein region  34.83 
 
 		 131 aa  48.9  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0269  nucleotidyltransferase  30.3 
 
 		 135 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0210  hypothetical protein  32.81 
 
 		 144 aa  48.5  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.281123  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1589  hypothetical protein  31.03 
 
 		 145 aa  48.1  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0659  hypothetical protein  31.48 
 
 		 140 aa  48.5  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000879573  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1106  hypothetical protein  29.84 
 
 		 144 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00999093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3654  hypothetical protein  30.51 
 
 		 137 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.544333  normal  0.731043 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2316  hypothetical protein  31.53 
 
 		 105 aa  47.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0239991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0428  DNA polymerase, beta-like region  27.97 
 
 		 153 aa  47.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0480568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1589  DNA polymerase beta domain protein region  32.58 
 
 		 132 aa  48.1  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.382693  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0893  DNA polymerase beta domain-containing protein region  29.66 
 
 		 143 aa  47.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1769  hypothetical protein  33.33 
 
 		 292 aa  47.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.026632  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1861  DNA polymerase beta subunit  29.23 
 
 		 140 aa  47  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>