68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0762 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0762  hypothetical protein  100 
 
 
137 aa  280  4.0000000000000003e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.120748 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4417  hypothetical protein  83.94 
 
 
137 aa  245  1e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.126362 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2733  protein of unknown function DUF86  58.39 
 
 
138 aa  165  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.226128  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2562  protein of unknown function DUF86  41.3 
 
 
138 aa  122  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0224  protein of unknown function DUF86  36.72 
 
 
130 aa  100  6e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0363  hypothetical protein  37.8 
 
 
139 aa  77.8  0.00000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3258  hypothetical protein  33.58 
 
 
139 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115451  hitchhiker  2.57897e-16 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0659  hypothetical protein  33.58 
 
 
140 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000879573  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1667  protein of unknown function DUF86  28.68 
 
 
139 aa  73.6  0.0000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2316  hypothetical protein  36.36 
 
 
105 aa  72  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0239991  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2568  protein of unknown function DUF86  32.35 
 
 
140 aa  71.6  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0186  hypothetical protein  32.48 
 
 
149 aa  70.9  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.894445 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  31.25 
 
 
271 aa  68.6  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1311  hypothetical protein  29.71 
 
 
141 aa  68.2  0.00000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1671  protein of unknown function DUF86  27.78 
 
 
139 aa  67.4  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0393  hypothetical protein  29.23 
 
 
142 aa  64.7  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.109457  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0546  protein of unknown function DUF86  29.32 
 
 
151 aa  63.5  0.0000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000598911  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1679  hypothetical protein  35.66 
 
 
143 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000033772  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2194  protein of unknown function DUF86  25.76 
 
 
143 aa  61.6  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000224954  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0770  hypothetical protein  32.58 
 
 
143 aa  60.8  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.465688 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0245  protein of unknown function DUF86  27.27 
 
 
141 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2243  hypothetical protein  26.02 
 
 
146 aa  59.3  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.125397  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0128  protein of unknown function DUF86  29.2 
 
 
140 aa  58.2  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00082454  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1106  hypothetical protein  32.06 
 
 
144 aa  57  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00999093  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0216  hypothetical protein  28.26 
 
 
141 aa  56.6  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2333  hypothetical protein  29.37 
 
 
136 aa  55.5  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1317  hypothetical protein  26.4 
 
 
138 aa  55.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1792  hypothetical protein  34.21 
 
 
295 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.210053 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3045  hypothetical protein  33.61 
 
 
142 aa  53.9  0.0000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.161016  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1862  hypothetical protein  22.48 
 
 
139 aa  53.9  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0761  hypothetical protein  36.9 
 
 
145 aa  53.1  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0131457  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2164  hypothetical protein  24.09 
 
 
142 aa  53.1  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0179  hypothetical protein  31.82 
 
 
128 aa  52.8  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00352921  normal  0.908992 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1971  protein of unknown function DUF86  31.03 
 
 
136 aa  52  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.190961 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3166  hypothetical protein  34.52 
 
 
133 aa  51.6  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2947  hypothetical protein  31.58 
 
 
140 aa  52  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2423  hypothetical protein  27.97 
 
 
135 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1440  hypothetical protein  33.33 
 
 
252 aa  51.2  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1224  protein of unknown function DUF86  27.74 
 
 
142 aa  51.2  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1762  hypothetical protein  32.46 
 
 
276 aa  50.4  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.254099  normal  0.270022 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3046  protein of unknown function DUF86  27.56 
 
 
145 aa  50.8  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1074  hypothetical protein  25.58 
 
 
143 aa  50.4  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.673636  normal  0.243145 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2953  hypothetical protein  35.71 
 
 
146 aa  50.4  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4529  hypothetical protein  32.14 
 
 
132 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.249791  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1275  hypothetical protein  26.89 
 
 
140 aa  49.3  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000365533 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0134  hypothetical protein  28 
 
 
142 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3016  hypothetical protein  28.91 
 
 
131 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0544  hypothetical protein  26.72 
 
 
145 aa  47.4  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00745715  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0759  hypothetical protein  33.04 
 
 
141 aa  47.4  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.17486  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1589  hypothetical protein  27.2 
 
 
145 aa  47  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2557  hypothetical protein  46.15 
 
 
55 aa  46.6  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2344  protein of unknown function DUF86  30 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1403  hypothetical protein  29.55 
 
 
149 aa  46.2  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0680673  normal  0.202766 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0894  hypothetical protein  32.94 
 
 
139 aa  45.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0270  hypothetical protein  30.23 
 
 
147 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1769  hypothetical protein  26.39 
 
 
292 aa  44.3  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.026632  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1588  protein of unknown function DUF86  28.74 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.181939  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1396  protein of unknown function DUF86  27.82 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026346  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0767  hypothetical protein  27.54 
 
 
139 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0768  hypothetical protein  27.54 
 
 
139 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1470  protein of unknown function DUF86  28.72 
 
 
139 aa  42.7  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.35466  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4098  hypothetical protein  28.03 
 
 
135 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272071  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5680  hypothetical protein  29.07 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0684551  hitchhiker  0.00143143 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2977  protein of unknown function DUF86  26.19 
 
 
140 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0295  protein of unknown function DUF86  26.32 
 
 
116 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.603584 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1815  hypothetical protein  29.09 
 
 
137 aa  41.6  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000107502  normal  0.591641 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2972  hypothetical protein  32.56 
 
 
46 aa  40.4  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2193  hypothetical protein  48.48 
 
 
113 aa  40  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.242589  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>