70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2423 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2423  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  270  4.0000000000000004e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0270  hypothetical protein  63.43 
 
 
147 aa  184  4e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5680  hypothetical protein  64.18 
 
 
137 aa  184  4e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0684551  hitchhiker  0.00143143 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2344  protein of unknown function DUF86  62.12 
 
 
140 aa  166  1e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0894  hypothetical protein  55.64 
 
 
139 aa  154  5.0000000000000005e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1074  hypothetical protein  52.24 
 
 
143 aa  153  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.673636  normal  0.243145 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2947  hypothetical protein  51.13 
 
 
140 aa  150  5e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0134  hypothetical protein  51.13 
 
 
142 aa  149  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3166  hypothetical protein  53.91 
 
 
133 aa  146  8e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1275  hypothetical protein  47.76 
 
 
140 aa  140  8e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000365533 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1396  protein of unknown function DUF86  45.8 
 
 
144 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026346  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2977  protein of unknown function DUF86  41.79 
 
 
140 aa  120  7e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1251  protein of unknown function DUF86  39.55 
 
 
141 aa  113  6.9999999999999995e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.414648 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2953  hypothetical protein  36.64 
 
 
146 aa  103  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1971  protein of unknown function DUF86  39.06 
 
 
136 aa  102  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.190961 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1588  protein of unknown function DUF86  37.01 
 
 
138 aa  100  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.181939  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0767  hypothetical protein  34.38 
 
 
139 aa  92.8  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0768  hypothetical protein  34.38 
 
 
139 aa  92.8  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1470  protein of unknown function DUF86  33.59 
 
 
139 aa  92.8  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.35466  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2333  hypothetical protein  33.85 
 
 
136 aa  91.7  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1815  hypothetical protein  39.42 
 
 
137 aa  87.8  5e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000107502  normal  0.591641 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2629  protein of unknown function DUF86  62.12 
 
 
85 aa  85.9  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.436875  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3254  protein of unknown function DUF86  37.23 
 
 
140 aa  82  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1945  hypothetical protein  34.43 
 
 
131 aa  82.8  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.755475  normal  0.160304 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2568  protein of unknown function DUF86  34.59 
 
 
140 aa  79  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4098  hypothetical protein  35.66 
 
 
135 aa  73.6  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272071  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3258  hypothetical protein  33.33 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115451  hitchhiker  2.57897e-16 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3016  hypothetical protein  33.03 
 
 
131 aa  67.4  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4529  hypothetical protein  32.77 
 
 
132 aa  67.4  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.249791  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1679  hypothetical protein  41.67 
 
 
143 aa  67  0.00000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000033772  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0224  protein of unknown function DUF86  37.5 
 
 
130 aa  67  0.00000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0128  protein of unknown function DUF86  31.2 
 
 
140 aa  65.1  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00082454  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3653  hypothetical protein  32.56 
 
 
137 aa  62  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.352214  normal  0.739112 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2243  hypothetical protein  37.04 
 
 
146 aa  61.2  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.125397  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4417  hypothetical protein  33.06 
 
 
137 aa  60.8  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.126362 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1862  hypothetical protein  24.6 
 
 
139 aa  60.8  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2733  protein of unknown function DUF86  36.59 
 
 
138 aa  60.1  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.226128  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0659  hypothetical protein  27.03 
 
 
140 aa  59.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000879573  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0210  hypothetical protein  32.97 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.281123  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1589  hypothetical protein  31.53 
 
 
145 aa  58.2  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0544  hypothetical protein  30.77 
 
 
145 aa  57  0.00000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00745715  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0363  hypothetical protein  27.97 
 
 
139 aa  57  0.00000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1671  protein of unknown function DUF86  32.65 
 
 
139 aa  56.6  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0186  hypothetical protein  40.26 
 
 
149 aa  55.5  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.894445 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1762  hypothetical protein  31.52 
 
 
276 aa  52.8  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.254099  normal  0.270022 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1317  hypothetical protein  29.11 
 
 
138 aa  53.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1667  protein of unknown function DUF86  24.43 
 
 
139 aa  53.5  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1224  protein of unknown function DUF86  33.67 
 
 
142 aa  52  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0762  hypothetical protein  27.97 
 
 
137 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.120748 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1440  hypothetical protein  32.61 
 
 
252 aa  51.6  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1792  hypothetical protein  33.33 
 
 
295 aa  51.2  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.210053 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0245  protein of unknown function DUF86  28.91 
 
 
141 aa  50.8  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1769  hypothetical protein  23.66 
 
 
292 aa  48.9  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.026632  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0179  hypothetical protein  29.59 
 
 
128 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00352921  normal  0.908992 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2562  protein of unknown function DUF86  29.67 
 
 
138 aa  48.5  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0393  hypothetical protein  33.71 
 
 
142 aa  47.8  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.109457  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3045  hypothetical protein  34.09 
 
 
142 aa  47  0.00009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.161016  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  32.1 
 
 
271 aa  47  0.00009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1311  hypothetical protein  35.29 
 
 
141 aa  47  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0770  hypothetical protein  24 
 
 
143 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.465688 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0546  protein of unknown function DUF86  38.55 
 
 
151 aa  45.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000598911  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0429  hypothetical protein  25.64 
 
 
141 aa  45.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0671683  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2164  hypothetical protein  27.78 
 
 
142 aa  44.3  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1403  hypothetical protein  24.21 
 
 
149 aa  42.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0680673  normal  0.202766 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0761  hypothetical protein  33.78 
 
 
145 aa  42.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0131457  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0319  hypothetical protein  28.24 
 
 
142 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1106  hypothetical protein  31.75 
 
 
144 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00999093  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2280  hypothetical protein  46.34 
 
 
51 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00520826  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2972  hypothetical protein  44.74 
 
 
46 aa  40.8  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2194  protein of unknown function DUF86  27.59 
 
 
143 aa  40.8  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000224954  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>