71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1588 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1588  protein of unknown function DUF86  100 
 
 		 138 aa  288  2e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.181939  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0768  hypothetical protein  81.75 
 
 		 139 aa  242  9.999999999999999e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0767  hypothetical protein  81.75 
 
 		 139 aa  242  9.999999999999999e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1470  protein of unknown function DUF86  80.29 
 
 		 139 aa  239  7.999999999999999e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.35466  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1971  protein of unknown function DUF86  63.7 
 
 		 136 aa  186  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.190961 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1815  hypothetical protein  62.96 
 
 		 137 aa  182  9e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000107502  normal  0.591641 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2333  hypothetical protein  59.09 
 
 		 136 aa  169  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1862  hypothetical protein  39.69 
 
 		 139 aa  105  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0270  hypothetical protein  38.35 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5680  hypothetical protein  37.23 
 
 		 137 aa  100  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0684551  hitchhiker  0.00143143 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3254  protein of unknown function DUF86  41.38 
 
 		 140 aa  100  8e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2423  hypothetical protein  37.01 
 
 		 135 aa  100  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2947  hypothetical protein  36.8 
 
 		 140 aa  99.8  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2344  protein of unknown function DUF86  37.98 
 
 		 140 aa  95.5  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0134  hypothetical protein  34.4 
 
 		 142 aa  93.6  9e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3166  hypothetical protein  32.81 
 
 		 133 aa  93.2  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1074  hypothetical protein  34.92 
 
 		 143 aa  92.4  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.673636  normal  0.243145 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1275  hypothetical protein  33.33 
 
 		 140 aa  90.1  8e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000365533 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0894  hypothetical protein  34.33 
 
 		 139 aa  89  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2953  hypothetical protein  31.11 
 
 		 146 aa  83.6  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1396  protein of unknown function DUF86  34.62 
 
 		 144 aa  82.4  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026346  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1671  protein of unknown function DUF86  28.24 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3258  hypothetical protein  34.91 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115451  hitchhiker  2.57897e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2977  protein of unknown function DUF86  28.79 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2568  protein of unknown function DUF86  37.65 
 
 		 140 aa  70.1  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1945  hypothetical protein  31.25 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.755475  normal  0.160304 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0210  hypothetical protein  33.64 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.281123  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4529  hypothetical protein  29.6 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.249791  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1251  protein of unknown function DUF86  25.19 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.414648 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0659  hypothetical protein  31.68 
 
 		 140 aa  62  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000879573  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0224  protein of unknown function DUF86  31.25 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2629  protein of unknown function DUF86  45.45 
 
 		 85 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.436875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1589  hypothetical protein  31.82 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2972  hypothetical protein  58.97 
 
 		 46 aa  58.5  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0128  protein of unknown function DUF86  25.76 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00082454  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1667  protein of unknown function DUF86  26.23 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0544  hypothetical protein  29.92 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00745715  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0179  hypothetical protein  27.64 
 
 		 128 aa  57  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00352921  normal  0.908992 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1679  hypothetical protein  33.71 
 
 		 143 aa  57  0.00000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000033772  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0245  protein of unknown function DUF86  23.66 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0073  hypothetical protein  31.78 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.483504  normal  0.176783 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3016  hypothetical protein  28.26 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4098  hypothetical protein  32.98 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1792  hypothetical protein  32.1 
 
 		 295 aa  53.5  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210053 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3653  hypothetical protein  37.7 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.352214  normal  0.739112 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0186  hypothetical protein  24.6 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.894445 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0770  hypothetical protein  25.2 
 
 		 143 aa  52.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465688 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0319  hypothetical protein  28.46 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1311  hypothetical protein  31.46 
 
 		 141 aa  51.6  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2194  protein of unknown function DUF86  28.57 
 
 		 143 aa  50.8  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000224954  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1769  hypothetical protein  25.71 
 
 		 292 aa  50.8  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.026632  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4417  hypothetical protein  31.87 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.126362 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0393  hypothetical protein  31.58 
 
 		 142 aa  50.4  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.109457  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0363  hypothetical protein  32.56 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3045  hypothetical protein  29.36 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.161016  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1106  hypothetical protein  25.76 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00999093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1317  hypothetical protein  27.16 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0546  protein of unknown function DUF86  28.8 
 
 		 151 aa  48.9  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000598911  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2164  hypothetical protein  31.34 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1440  hypothetical protein  30 
 
 		 252 aa  47.8  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1762  hypothetical protein  28.75 
 
 		 276 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.254099  normal  0.270022 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1224  protein of unknown function DUF86  23.66 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0761  hypothetical protein  26.74 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0131457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2243  hypothetical protein  24.71 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.125397  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2316  hypothetical protein  29.21 
 
 		 105 aa  45.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0239991  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2901  protein of unknown function DUF86  22.73 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3046  protein of unknown function DUF86  27.38 
 
 		 145 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  26.67 
 
 		 271 aa  43.9  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0762  hypothetical protein  28.74 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.120748 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1884  hypothetical protein  32.81 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.234797 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2733  protein of unknown function DUF86  26.37 
 
 		 138 aa  42  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.226128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>