63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1074 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1074  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  294  2e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.673636  normal  0.243145 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0134  hypothetical protein  75.71 
 
 
142 aa  223  1e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2947  hypothetical protein  73.68 
 
 
140 aa  217  5e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1275  hypothetical protein  72.46 
 
 
140 aa  207  5e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000365533 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2423  hypothetical protein  52.24 
 
 
135 aa  153  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5680  hypothetical protein  49.62 
 
 
137 aa  149  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0684551  hitchhiker  0.00143143 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0270  hypothetical protein  49.62 
 
 
147 aa  148  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0894  hypothetical protein  50 
 
 
139 aa  143  9e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3166  hypothetical protein  49.62 
 
 
133 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1396  protein of unknown function DUF86  46.72 
 
 
144 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026346  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2977  protein of unknown function DUF86  44.93 
 
 
140 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2344  protein of unknown function DUF86  45.11 
 
 
140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1251  protein of unknown function DUF86  40 
 
 
141 aa  118  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.414648 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2953  hypothetical protein  38.06 
 
 
146 aa  97.8  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1588  protein of unknown function DUF86  34.92 
 
 
138 aa  92.4  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.181939  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0768  hypothetical protein  32.26 
 
 
139 aa  82  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0767  hypothetical protein  32.26 
 
 
139 aa  82  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1470  protein of unknown function DUF86  32.26 
 
 
139 aa  80.9  0.000000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.35466  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2333  hypothetical protein  34.38 
 
 
136 aa  80.1  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1971  protein of unknown function DUF86  31.75 
 
 
136 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.190961 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1945  hypothetical protein  34.92 
 
 
131 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.755475  normal  0.160304 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1815  hypothetical protein  31.2 
 
 
137 aa  70.9  0.000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000107502  normal  0.591641 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3258  hypothetical protein  37.36 
 
 
139 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115451  hitchhiker  2.57897e-16 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2629  protein of unknown function DUF86  45.59 
 
 
85 aa  64.7  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.436875  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1862  hypothetical protein  32.11 
 
 
139 aa  63.5  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1679  hypothetical protein  39.05 
 
 
143 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000033772  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1671  protein of unknown function DUF86  28.68 
 
 
139 aa  62  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1589  hypothetical protein  36.43 
 
 
145 aa  62  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2733  protein of unknown function DUF86  36.46 
 
 
138 aa  59.3  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.226128  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4529  hypothetical protein  31.4 
 
 
132 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.249791  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0659  hypothetical protein  32.98 
 
 
140 aa  57.8  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000879573  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0224  protein of unknown function DUF86  30.77 
 
 
130 aa  57  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2243  hypothetical protein  29.63 
 
 
146 aa  56.2  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.125397  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3254  protein of unknown function DUF86  25.44 
 
 
140 aa  55.8  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0186  hypothetical protein  29.57 
 
 
149 aa  55.1  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.894445 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2568  protein of unknown function DUF86  31.11 
 
 
140 aa  55.1  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  37.5 
 
 
271 aa  54.3  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4417  hypothetical protein  25.6 
 
 
137 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.126362 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2562  protein of unknown function DUF86  26.77 
 
 
138 aa  52.8  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0762  hypothetical protein  25.58 
 
 
137 aa  50.4  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.120748 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0544  hypothetical protein  28.57 
 
 
145 aa  49.7  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00745715  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0179  hypothetical protein  29.79 
 
 
128 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00352921  normal  0.908992 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1667  protein of unknown function DUF86  24.37 
 
 
139 aa  49.3  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1762  hypothetical protein  34.34 
 
 
276 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.254099  normal  0.270022 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1792  hypothetical protein  34.34 
 
 
295 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.210053 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0245  protein of unknown function DUF86  27.36 
 
 
141 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0393  hypothetical protein  28.3 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.109457  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1440  hypothetical protein  33.33 
 
 
252 aa  46.2  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0128  protein of unknown function DUF86  24.06 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00082454  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4098  hypothetical protein  30.6 
 
 
135 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272071  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3653  hypothetical protein  30.99 
 
 
137 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.352214  normal  0.739112 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1311  hypothetical protein  27.52 
 
 
141 aa  43.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2280  hypothetical protein  48.65 
 
 
51 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00520826  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0363  hypothetical protein  26.12 
 
 
139 aa  42.4  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2107  hypothetical protein  30.38 
 
 
138 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0461455  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3045  hypothetical protein  28.74 
 
 
142 aa  42.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.161016  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1317  hypothetical protein  26.32 
 
 
138 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0210  hypothetical protein  26.6 
 
 
144 aa  42.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.281123  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1224  protein of unknown function DUF86  28.26 
 
 
142 aa  42  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3016  hypothetical protein  28.24 
 
 
131 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1403  hypothetical protein  22.73 
 
 
149 aa  41.6  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0680673  normal  0.202766 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0319  hypothetical protein  30.91 
 
 
142 aa  41.2  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1769  hypothetical protein  23.14 
 
 
292 aa  40.8  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.026632  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>