64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_1762 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_1762  hypothetical protein  100 
 
 		 276 aa  565  1e-160  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.254099  normal  0.270022 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1792  hypothetical protein  93.84 
 
 		 295 aa  525  1e-148  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210053 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1440  hypothetical protein  94.05 
 
 		 252 aa  486  1e-136  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0759  hypothetical protein  55.15 
 
 		 141 aa  144  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.17486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0758  DNA polymerase beta subunit  48.72 
 
 		 136 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.258998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3045  hypothetical protein  40.91 
 
 		 142 aa  110  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.161016  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0761  hypothetical protein  45.53 
 
 		 145 aa  108  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0131457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0760  DNA polymerase beta subunit  46.36 
 
 		 133 aa  98.2  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0261005  normal  0.995846 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3044  hypothetical protein  42.34 
 
 		 129 aa  86.7  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.137112  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1314  hypothetical protein  41.44 
 
 		 142 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2568  protein of unknown function DUF86  31.58 
 
 		 140 aa  67.4  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3258  hypothetical protein  28.26 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115451  hitchhiker  2.57897e-16 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0270  hypothetical protein  30.48 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0224  protein of unknown function DUF86  28.57 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1105  DNA polymerase beta subunit  31.62 
 
 		 162 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00137564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4417  hypothetical protein  35.09 
 
 		 137 aa  53.5  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.126362 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0074  DNA polymerase beta subunit  30.09 
 
 		 167 aa  53.1  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.649799  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2977  protein of unknown function DUF86  29.52 
 
 		 140 aa  53.1  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3166  hypothetical protein  36.14 
 
 		 133 aa  53.1  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2423  hypothetical protein  31.52 
 
 		 135 aa  52.8  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0216  hypothetical protein  30.84 
 
 		 141 aa  52.4  0.000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2562  protein of unknown function DUF86  31.4 
 
 		 138 aa  52  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0179  hypothetical protein  37.14 
 
 		 128 aa  52  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00352921  normal  0.908992 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2344  protein of unknown function DUF86  35.71 
 
 		 140 aa  51.6  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0762  hypothetical protein  32.46 
 
 		 137 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.120748 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1422  DNA polymerase beta subunit  30.47 
 
 		 123 aa  50.1  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.747879  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0882  DNA polymerase beta subunit  29.91 
 
 		 156 aa  49.3  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0210  hypothetical protein  41.18 
 
 		 144 aa  49.3  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.281123  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1074  hypothetical protein  34.34 
 
 		 143 aa  49.3  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.673636  normal  0.243145 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3254  protein of unknown function DUF86  26.79 
 
 		 140 aa  48.9  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0073  hypothetical protein  28 
 
 		 112 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.483504  normal  0.176783 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3654  hypothetical protein  36.84 
 
 		 137 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.544333  normal  0.731043 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0545  DNA polymerase beta domain protein region  28.85 
 
 		 135 aa  47.4  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00116753  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2352  DNA polymerase, beta-like region  30.25 
 
 		 148 aa  48.1  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00951181  normal  0.0970434 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0364  DNA polymerase beta subunit  28.07 
 
 		 148 aa  48.1  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5680  hypothetical protein  23.81 
 
 		 137 aa  47.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0684551  hitchhiker  0.00143143 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0186  hypothetical protein  26.55 
 
 		 149 aa  47.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.894445 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1224  protein of unknown function DUF86  27.19 
 
 		 142 aa  48.1  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1588  protein of unknown function DUF86  28.75 
 
 		 138 aa  47.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.181939  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1396  protein of unknown function DUF86  27.68 
 
 		 144 aa  47.4  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026346  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1106  hypothetical protein  27.68 
 
 		 144 aa  46.6  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00999093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0324  hypothetical protein  30.68 
 
 		 135 aa  46.6  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1251  protein of unknown function DUF86  26.67 
 
 		 141 aa  45.8  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.414648 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2164  hypothetical protein  26.92 
 
 		 142 aa  45.8  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2243  hypothetical protein  23.58 
 
 		 146 aa  45.8  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.125397  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0659  hypothetical protein  26.21 
 
 		 140 aa  45.8  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000879573  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2733  protein of unknown function DUF86  34.88 
 
 		 138 aa  45.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.226128  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0128  protein of unknown function DUF86  23.85 
 
 		 140 aa  44.3  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00082454  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4484  DNA polymerase beta domain protein region  25.2 
 
 		 146 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1470  protein of unknown function DUF86  27.5 
 
 		 139 aa  44.3  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.35466  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3653  hypothetical protein  30.36 
 
 		 137 aa  44.3  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.352214  normal  0.739112 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0768  hypothetical protein  27.5 
 
 		 139 aa  44.3  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0767  hypothetical protein  27.5 
 
 		 139 aa  44.3  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1972  DNA polymerase beta domain protein region  35.24 
 
 		 131 aa  43.5  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.18731 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1693  hypothetical protein  32.26 
 
 		 92 aa  43.1  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00000689482  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0245  protein of unknown function DUF86  29.2 
 
 		 141 aa  43.1  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1679  hypothetical protein  31.11 
 
 		 143 aa  43.1  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000033772  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1370  DNA polymerase beta subunit  30.28 
 
 		 241 aa  43.1  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0334218 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4098  hypothetical protein  31.68 
 
 		 135 aa  42.7  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0178  DNA polymerase, beta-like region  26.8 
 
 		 163 aa  42.7  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0107452  normal  0.933077 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0134  hypothetical protein  28.42 
 
 		 142 aa  42.4  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2422  DNA polymerase beta subunit  29.79 
 
 		 135 aa  42  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1532  hypothetical protein  30.12 
 
 		 135 aa  42  0.01  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.693536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  28.04 
 
 		 271 aa  42  0.01  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>