50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I3045 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I3045  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  289  8e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.161016  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0761  hypothetical protein  65.94 
 
 		 145 aa  186  1e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0131457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1792  hypothetical protein  40.91 
 
 		 295 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210053 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1762  hypothetical protein  40.91 
 
 		 276 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.254099  normal  0.270022 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1440  hypothetical protein  40.91 
 
 		 252 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0759  hypothetical protein  38.81 
 
 		 141 aa  100  6e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.17486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1314  hypothetical protein  37.65 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2733  protein of unknown function DUF86  35.19 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.226128  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0762  hypothetical protein  33.61 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.120748 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3258  hypothetical protein  35.56 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115451  hitchhiker  2.57897e-16 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4417  hypothetical protein  40.48 
 
 		 137 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.126362 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1396  protein of unknown function DUF86  34.78 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026346  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1815  hypothetical protein  34.58 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000107502  normal  0.591641 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3254  protein of unknown function DUF86  28.24 
 
 		 140 aa  51.6  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0894  hypothetical protein  37.35 
 
 		 139 aa  50.4  0.000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1588  protein of unknown function DUF86  29.36 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.181939  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2977  protein of unknown function DUF86  32.94 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3166  hypothetical protein  35.21 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1971  protein of unknown function DUF86  32.95 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.190961 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0270  hypothetical protein  32.26 
 
 		 147 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2423  hypothetical protein  34.09 
 
 		 135 aa  47  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1470  protein of unknown function DUF86  29.7 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.35466  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2164  hypothetical protein  29.11 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0224  protein of unknown function DUF86  29.79 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0767  hypothetical protein  30.77 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2947  hypothetical protein  31.25 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0179  hypothetical protein  31.88 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00352921  normal  0.908992 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1251  protein of unknown function DUF86  32.86 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.414648 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0768  hypothetical protein  30.77 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5680  hypothetical protein  31.18 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0684551  hitchhiker  0.00143143 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2629  protein of unknown function DUF86  33.8 
 
 		 85 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.436875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2568  protein of unknown function DUF86  29.03 
 
 		 140 aa  44.7  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0324  hypothetical protein  28.79 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2344  protein of unknown function DUF86  29.89 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1693  hypothetical protein  28.24 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00000689482  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0245  protein of unknown function DUF86  26.05 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2333  hypothetical protein  25.76 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3653  hypothetical protein  33.71 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.352214  normal  0.739112 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1532  hypothetical protein  30.12 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.693536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2562  protein of unknown function DUF86  33.73 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1074  hypothetical protein  28.74 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.673636  normal  0.243145 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2243  hypothetical protein  26.88 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.125397  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4098  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0275  hypothetical protein  42.86 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0134  hypothetical protein  27.63 
 
 		 142 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0997  protein of unknown function DUF86  40.91 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0512778 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0659  hypothetical protein  26.47 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000879573  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0770  hypothetical protein  26.42 
 
 		 143 aa  40.8  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465688 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2901  protein of unknown function DUF86  25.24 
 
 		 145 aa  40.8  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2953  hypothetical protein  32.43 
 
 		 146 aa  40.4  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>