22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1693 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1693  hypothetical protein  100 
 
 
92 aa  185  2e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00000689482  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1437  hypothetical protein  48 
 
 
136 aa  84.7  4e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000000308742  hitchhiker  0.00000614193 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1026  hypothetical protein  52.33 
 
 
140 aa  75.9  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.304119  normal  0.375352 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1253  hypothetical protein  38.2 
 
 
142 aa  55.1  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3258  hypothetical protein  30.68 
 
 
139 aa  49.3  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115451  hitchhiker  2.57897e-16 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0224  protein of unknown function DUF86  24.42 
 
 
130 aa  48.9  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0186  hypothetical protein  34.48 
 
 
149 aa  48.5  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.894445 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2568  protein of unknown function DUF86  26.83 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1183  hypothetical protein  44.44 
 
 
57 aa  46.6  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2352  hypothetical protein  30.34 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000399526  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0319  hypothetical protein  31.11 
 
 
142 aa  45.4  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0761  hypothetical protein  32.81 
 
 
145 aa  43.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0131457  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3045  hypothetical protein  28.24 
 
 
142 aa  43.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.161016  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1762  hypothetical protein  32.26 
 
 
276 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.254099  normal  0.270022 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1224  protein of unknown function DUF86  27.38 
 
 
142 aa  43.5  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1440  hypothetical protein  32.26 
 
 
252 aa  42.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2194  protein of unknown function DUF86  30.43 
 
 
143 aa  42.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000224954  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1103  hypothetical protein  36 
 
 
139 aa  42  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.320757 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1792  hypothetical protein  33.87 
 
 
295 aa  42  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.210053 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0245  protein of unknown function DUF86  30 
 
 
141 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1311  hypothetical protein  21.84 
 
 
141 aa  41.2  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1589  hypothetical protein  33.87 
 
 
145 aa  40.4  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>