11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1253 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1253  hypothetical protein  100 
 
 
142 aa  271  3e-72  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0319  hypothetical protein  35.29 
 
 
142 aa  73.9  0.0000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1437  hypothetical protein  28.68 
 
 
136 aa  56.2  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000000308742  hitchhiker  0.00000614193 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1183  hypothetical protein  50 
 
 
57 aa  55.8  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1693  hypothetical protein  38.2 
 
 
92 aa  55.1  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00000689482  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0186  hypothetical protein  27.83 
 
 
149 aa  51.6  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.894445 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1026  hypothetical protein  35.25 
 
 
140 aa  47.4  0.00006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.304119  normal  0.375352 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2194  protein of unknown function DUF86  27.18 
 
 
143 aa  47  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000224954  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0475  hypothetical protein  31.48 
 
 
134 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0944  hypothetical protein  33.33 
 
 
137 aa  41.2  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.451382  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2164  hypothetical protein  24.82 
 
 
142 aa  40.8  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>