66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1792 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_1792  hypothetical protein  100 
 
 		 295 aa  604  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210053 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1762  hypothetical protein  93.84 
 
 		 276 aa  525  1e-148  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.254099  normal  0.270022 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1440  hypothetical protein  92.46 
 
 		 252 aa  474  1e-133  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0759  hypothetical protein  54.41 
 
 		 141 aa  144  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.17486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0758  DNA polymerase beta subunit  48.72 
 
 		 136 aa  119  9e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.258998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3045  hypothetical protein  40.91 
 
 		 142 aa  113  4.0000000000000004e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.161016  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0761  hypothetical protein  45.53 
 
 		 145 aa  108  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0131457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0760  DNA polymerase beta subunit  45.69 
 
 		 133 aa  99  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0261005  normal  0.995846 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3044  hypothetical protein  40.71 
 
 		 129 aa  85.1  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.137112  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2568  protein of unknown function DUF86  33.33 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1314  hypothetical protein  38.74 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0224  protein of unknown function DUF86  31.25 
 
 		 130 aa  65.1  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3258  hypothetical protein  33.64 
 
 		 139 aa  64.7  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115451  hitchhiker  2.57897e-16 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4417  hypothetical protein  36.59 
 
 		 137 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.126362 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1105  DNA polymerase beta subunit  32.2 
 
 		 162 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00137564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0074  DNA polymerase beta subunit  33.05 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.649799  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0270  hypothetical protein  32.56 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2344  protein of unknown function DUF86  35.71 
 
 		 140 aa  54.3  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0762  hypothetical protein  34.21 
 
 		 137 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.120748 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2562  protein of unknown function DUF86  31.82 
 
 		 138 aa  53.9  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0882  DNA polymerase beta subunit  30.63 
 
 		 156 aa  53.5  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1588  protein of unknown function DUF86  32.1 
 
 		 138 aa  53.5  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.181939  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3254  protein of unknown function DUF86  28.72 
 
 		 140 aa  53.5  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3166  hypothetical protein  34.57 
 
 		 133 aa  52.4  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0324  hypothetical protein  31.46 
 
 		 135 aa  52  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2733  protein of unknown function DUF86  34.48 
 
 		 138 aa  52  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.226128  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2423  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2243  hypothetical protein  26.02 
 
 		 146 aa  50.4  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.125397  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1422  DNA polymerase beta subunit  31.25 
 
 		 123 aa  49.3  0.00007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.747879  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2977  protein of unknown function DUF86  30.43 
 
 		 140 aa  49.3  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0659  hypothetical protein  29.37 
 
 		 140 aa  49.3  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000879573  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1074  hypothetical protein  34.34 
 
 		 143 aa  49.3  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.673636  normal  0.243145 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0767  hypothetical protein  30 
 
 		 139 aa  48.9  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2352  DNA polymerase, beta-like region  34.09 
 
 		 148 aa  48.5  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00951181  normal  0.0970434 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1470  protein of unknown function DUF86  30 
 
 		 139 aa  48.5  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.35466  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0768  hypothetical protein  30 
 
 		 139 aa  48.9  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0245  protein of unknown function DUF86  30.36 
 
 		 141 aa  48.9  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1396  protein of unknown function DUF86  31.18 
 
 		 144 aa  48.9  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026346  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3654  hypothetical protein  36.84 
 
 		 137 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.544333  normal  0.731043 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0216  hypothetical protein  30.84 
 
 		 141 aa  47.8  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0210  hypothetical protein  41.18 
 
 		 144 aa  47  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.281123  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0179  hypothetical protein  31.31 
 
 		 128 aa  47.4  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00352921  normal  0.908992 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1532  hypothetical protein  30.77 
 
 		 135 aa  47.4  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.693536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4484  DNA polymerase beta domain protein region  25.18 
 
 		 146 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1679  hypothetical protein  32.94 
 
 		 143 aa  46.6  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000033772  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0186  hypothetical protein  27.43 
 
 		 149 aa  47  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.894445 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2164  hypothetical protein  28.97 
 
 		 142 aa  46.6  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0364  DNA polymerase beta subunit  28.57 
 
 		 148 aa  46.6  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5680  hypothetical protein  27.91 
 
 		 137 aa  46.6  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0684551  hitchhiker  0.00143143 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1224  protein of unknown function DUF86  26.55 
 
 		 142 aa  46.6  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2901  protein of unknown function DUF86  31.88 
 
 		 145 aa  45.8  0.0009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0178  DNA polymerase, beta-like region  28.87 
 
 		 163 aa  45.8  0.0009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0107452  normal  0.933077 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1370  DNA polymerase beta subunit  33.94 
 
 		 241 aa  45.4  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0334218 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  27.35 
 
 		 271 aa  44.7  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1815  hypothetical protein  31.87 
 
 		 137 aa  45.1  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000107502  normal  0.591641 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0545  DNA polymerase beta domain protein region  26.92 
 
 		 135 aa  44.7  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00116753  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0128  protein of unknown function DUF86  25.93 
 
 		 140 aa  43.5  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00082454  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0134  hypothetical protein  30.86 
 
 		 142 aa  43.9  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1972  DNA polymerase beta domain protein region  32.65 
 
 		 131 aa  43.1  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.18731 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4418  DNA polymerase beta subunit  27.56 
 
 		 148 aa  43.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234666 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0073  hypothetical protein  31.63 
 
 		 112 aa  43.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.483504  normal  0.176783 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1048  protein of unknown function DUF86  30.95 
 
 		 143 aa  43.1  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1275  hypothetical protein  32.5 
 
 		 140 aa  43.1  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000365533 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0944  hypothetical protein  29.76 
 
 		 137 aa  42.7  0.008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.451382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0770  hypothetical protein  26.96 
 
 		 143 aa  42.4  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465688 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0209  hypothetical protein  26.36 
 
 		 142 aa  42.4  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.184699  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>