82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3258 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3258  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  281  2.0000000000000002e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115451  hitchhiker  2.57897e-16 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0659  hypothetical protein  70.07 
 
 		 140 aa  204  4e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000879573  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2568  protein of unknown function DUF86  44.03 
 
 		 140 aa  116  7.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0245  protein of unknown function DUF86  34.78 
 
 		 141 aa  97.4  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0224  protein of unknown function DUF86  38.58 
 
 		 130 aa  96.7  9e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4417  hypothetical protein  37.23 
 
 		 137 aa  89.4  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.126362 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0128  protein of unknown function DUF86  35.82 
 
 		 140 aa  85.5  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00082454  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2194  protein of unknown function DUF86  35.34 
 
 		 143 aa  84.3  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000224954  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0134  hypothetical protein  40 
 
 		 142 aa  82.4  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1275  hypothetical protein  34.15 
 
 		 140 aa  77.4  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000365533 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2953  hypothetical protein  32.09 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0762  hypothetical protein  33.58 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.120748 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2947  hypothetical protein  43.33 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0216  hypothetical protein  30.16 
 
 		 141 aa  74.3  0.0000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0179  hypothetical protein  32.23 
 
 		 128 aa  74.3  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00352921  normal  0.908992 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0894  hypothetical protein  38.64 
 
 		 139 aa  73.6  0.0000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1588  protein of unknown function DUF86  34.91 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.181939  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1679  hypothetical protein  46.15 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000033772  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2423  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2243  hypothetical protein  37.5 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.125397  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1671  protein of unknown function DUF86  28.78 
 
 		 139 aa  72  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2733  protein of unknown function DUF86  33.58 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.226128  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2333  hypothetical protein  30.15 
 
 		 136 aa  70.9  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1589  hypothetical protein  33.06 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0363  hypothetical protein  33.05 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0186  hypothetical protein  42.68 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.894445 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0270  hypothetical protein  36.78 
 
 		 147 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0768  hypothetical protein  32.08 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0767  hypothetical protein  32.08 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1224  protein of unknown function DUF86  29.85 
 
 		 142 aa  70.1  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3166  hypothetical protein  32.69 
 
 		 133 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1074  hypothetical protein  37.36 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.673636  normal  0.243145 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1667  protein of unknown function DUF86  27.21 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2977  protein of unknown function DUF86  30.83 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0210  hypothetical protein  33.58 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.281123  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3653  hypothetical protein  35.48 
 
 		 137 aa  67.8  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.352214  normal  0.739112 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0770  hypothetical protein  33.06 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465688 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5680  hypothetical protein  33.33 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0684551  hitchhiker  0.00143143 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1470  protein of unknown function DUF86  29.52 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.35466  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1792  hypothetical protein  33.64 
 
 		 295 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210053 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1971  protein of unknown function DUF86  32.08 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.190961 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0883  hypothetical protein  41.94 
 
 		 97 aa  64.7  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000259898 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1106  hypothetical protein  28.35 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00999093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1251  protein of unknown function DUF86  35.23 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.414648 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0393  hypothetical protein  33.6 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.109457  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2164  hypothetical protein  27.61 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2344  protein of unknown function DUF86  32.98 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1762  hypothetical protein  28.26 
 
 		 276 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.254099  normal  0.270022 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4098  hypothetical protein  33.87 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2562  protein of unknown function DUF86  33.07 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1396  protein of unknown function DUF86  28.97 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026346  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1769  hypothetical protein  29.73 
 
 		 292 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.026632  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1440  hypothetical protein  28.26 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2316  hypothetical protein  34.95 
 
 		 105 aa  58.9  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0239991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4529  hypothetical protein  29.37 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.249791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1815  hypothetical protein  29.37 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000107502  normal  0.591641 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  32.56 
 
 		 271 aa  58.5  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1317  hypothetical protein  24.41 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1862  hypothetical protein  26.67 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1945  hypothetical protein  26.98 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.755475  normal  0.160304 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0073  hypothetical protein  27.88 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.483504  normal  0.176783 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1311  hypothetical protein  28.36 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0544  hypothetical protein  33.71 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00745715  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0546  protein of unknown function DUF86  38.71 
 
 		 151 aa  53.5  0.0000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000598911  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3045  hypothetical protein  35.56 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.161016  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1403  hypothetical protein  29.35 
 
 		 149 aa  51.6  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0680673  normal  0.202766 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3254  protein of unknown function DUF86  25.23 
 
 		 140 aa  50.4  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2629  protein of unknown function DUF86  34.62 
 
 		 85 aa  50.4  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.436875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2107  hypothetical protein  27.61 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0461455  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1693  hypothetical protein  30.68 
 
 		 92 aa  49.3  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00000689482  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1951  protein of unknown function DUF86  27.72 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0759  hypothetical protein  31.18 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.17486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0761  hypothetical protein  33.33 
 
 		 145 aa  47  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0131457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3016  hypothetical protein  27.69 
 
 		 131 aa  47  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3046  protein of unknown function DUF86  27.17 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3559  hypothetical protein  23.19 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2352  hypothetical protein  25.69 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000399526  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2901  protein of unknown function DUF86  26.09 
 
 		 145 aa  45.1  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1437  hypothetical protein  25.36 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000000308742  hitchhiker  0.00000614193 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1534  hypothetical protein  36.99 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1047  hypothetical protein  27.35 
 
 		 140 aa  40.4  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.68941  normal  0.087721 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1048  protein of unknown function DUF86  26.58 
 
 		 143 aa  40  0.009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>