37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0761 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_0761  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  290  4e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0131457  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3045  hypothetical protein  65.94 
 
 
142 aa  186  1e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.161016  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1762  hypothetical protein  45.53 
 
 
276 aa  108  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.254099  normal  0.270022 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1440  hypothetical protein  44.72 
 
 
252 aa  108  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1792  hypothetical protein  45.53 
 
 
295 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.210053 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0759  hypothetical protein  38.35 
 
 
141 aa  88.2  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.17486  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1314  hypothetical protein  37.7 
 
 
142 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4417  hypothetical protein  37.04 
 
 
137 aa  54.3  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.126362 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1815  hypothetical protein  35.23 
 
 
137 aa  53.1  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000107502  normal  0.591641 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1971  protein of unknown function DUF86  32.73 
 
 
136 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.190961 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0762  hypothetical protein  36.9 
 
 
137 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.120748 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3166  hypothetical protein  34.67 
 
 
133 aa  48.9  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2977  protein of unknown function DUF86  30.39 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0224  protein of unknown function DUF86  28.7 
 
 
130 aa  47.8  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3258  hypothetical protein  33.33 
 
 
139 aa  47  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115451  hitchhiker  2.57897e-16 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2568  protein of unknown function DUF86  28.07 
 
 
140 aa  47  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1588  protein of unknown function DUF86  26.74 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.181939  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2733  protein of unknown function DUF86  31.67 
 
 
138 aa  47  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.226128  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1251  protein of unknown function DUF86  28.38 
 
 
141 aa  45.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.414648 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0270  hypothetical protein  29.79 
 
 
147 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0179  hypothetical protein  30.53 
 
 
128 aa  44.7  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00352921  normal  0.908992 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1470  protein of unknown function DUF86  27.91 
 
 
139 aa  45.1  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.35466  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0768  hypothetical protein  27.91 
 
 
139 aa  44.7  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0767  hypothetical protein  27.91 
 
 
139 aa  44.7  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0216  hypothetical protein  30.69 
 
 
141 aa  43.9  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0894  hypothetical protein  35.71 
 
 
139 aa  43.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0944  hypothetical protein  30.77 
 
 
137 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.451382  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1693  hypothetical protein  32.81 
 
 
92 aa  43.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00000689482  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1396  protein of unknown function DUF86  29.06 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026346  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2423  hypothetical protein  33.78 
 
 
135 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2629  protein of unknown function DUF86  32.73 
 
 
85 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.436875  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0324  hypothetical protein  27.12 
 
 
135 aa  42  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3254  protein of unknown function DUF86  30.11 
 
 
140 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1862  hypothetical protein  30.65 
 
 
139 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2333  hypothetical protein  28.79 
 
 
136 aa  41.2  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0659  hypothetical protein  26.73 
 
 
140 aa  40.4  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000879573  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2947  hypothetical protein  29.73 
 
 
140 aa  40  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>