62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1862 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1862  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  285  2e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0768  hypothetical protein  40.46 
 
 		 139 aa  108  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0767  hypothetical protein  40.46 
 
 		 139 aa  108  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1588  protein of unknown function DUF86  39.69 
 
 		 138 aa  105  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.181939  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1470  protein of unknown function DUF86  38.93 
 
 		 139 aa  104  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.35466  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2333  hypothetical protein  40.17 
 
 		 136 aa  96.7  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1815  hypothetical protein  37.69 
 
 		 137 aa  92.4  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000107502  normal  0.591641 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1971  protein of unknown function DUF86  36.64 
 
 		 136 aa  90.9  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.190961 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1671  protein of unknown function DUF86  30.37 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2977  protein of unknown function DUF86  34.65 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3166  hypothetical protein  28.46 
 
 		 133 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1251  protein of unknown function DUF86  33.33 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.414648 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0128  protein of unknown function DUF86  31.03 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00082454  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3254  protein of unknown function DUF86  33.33 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1275  hypothetical protein  30.77 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000365533 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2953  hypothetical protein  27.91 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2947  hypothetical protein  32.11 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0134  hypothetical protein  34.82 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0270  hypothetical protein  27.82 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0894  hypothetical protein  27.27 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1667  protein of unknown function DUF86  26.77 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1074  hypothetical protein  32.11 
 
 		 143 aa  63.5  0.0000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.673636  normal  0.243145 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2344  protein of unknown function DUF86  27.01 
 
 		 140 aa  63.5  0.0000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1589  hypothetical protein  32.48 
 
 		 145 aa  63.5  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5680  hypothetical protein  26.32 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0684551  hitchhiker  0.00143143 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4417  hypothetical protein  24.03 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.126362 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2423  hypothetical protein  24.6 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0210  hypothetical protein  33.62 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.281123  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0073  hypothetical protein  37.14 
 
 		 112 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.483504  normal  0.176783 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0179  hypothetical protein  33.33 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00352921  normal  0.908992 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2568  protein of unknown function DUF86  34.44 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2733  protein of unknown function DUF86  35.16 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.226128  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3258  hypothetical protein  26.67 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115451  hitchhiker  2.57897e-16 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1396  protein of unknown function DUF86  34.31 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026346  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0186  hypothetical protein  30 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.894445 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1106  hypothetical protein  32.11 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00999093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0762  hypothetical protein  22.48 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.120748 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1769  hypothetical protein  30.97 
 
 		 292 aa  53.1  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.026632  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0224  protein of unknown function DUF86  28.24 
 
 		 130 aa  53.5  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1679  hypothetical protein  31.11 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000033772  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0659  hypothetical protein  30.36 
 
 		 140 aa  51.6  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000879573  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3016  hypothetical protein  29.9 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2562  protein of unknown function DUF86  24.81 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0363  hypothetical protein  31.46 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1945  hypothetical protein  23.85 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.755475  normal  0.160304 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2194  protein of unknown function DUF86  27.08 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000224954  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4529  hypothetical protein  28.16 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.249791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0770  hypothetical protein  25.64 
 
 		 143 aa  47  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465688 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1951  protein of unknown function DUF86  31.46 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3653  hypothetical protein  31.71 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.352214  normal  0.739112 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0544  hypothetical protein  26.61 
 
 		 145 aa  47  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00745715  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4098  hypothetical protein  31.71 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2316  hypothetical protein  28.57 
 
 		 105 aa  45.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0239991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0393  hypothetical protein  22.6 
 
 		 142 aa  44.7  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.109457  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1224  protein of unknown function DUF86  27.13 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1792  hypothetical protein  28.57 
 
 		 295 aa  42  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210053 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  25.95 
 
 		 271 aa  42  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0761  hypothetical protein  30.65 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0131457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2164  hypothetical protein  29.21 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1884  hypothetical protein  34.21 
 
 		 123 aa  40.8  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.234797 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0245  protein of unknown function DUF86  25.53 
 
 		 141 aa  40.4  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1370  DNA polymerase beta subunit  29.79 
 
 		 241 aa  40  0.01  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0334218 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>