16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1314 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1314  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  288  1e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1762  hypothetical protein  41.44 
 
 		 276 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.254099  normal  0.270022 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1440  hypothetical protein  41.59 
 
 		 252 aa  77  0.00000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0761  hypothetical protein  37.7 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0131457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3045  hypothetical protein  37.65 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.161016  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1792  hypothetical protein  38.74 
 
 		 295 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210053 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0759  hypothetical protein  36.04 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.17486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0210  hypothetical protein  30.28 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.281123  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0324  hypothetical protein  28.89 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0770  hypothetical protein  32.56 
 
 		 143 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465688 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1396  protein of unknown function DUF86  28.72 
 
 		 144 aa  44.7  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026346  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2977  protein of unknown function DUF86  29.07 
 
 		 140 aa  44.3  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1532  hypothetical protein  32.26 
 
 		 135 aa  43.9  0.0007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.693536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2164  hypothetical protein  29.03 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1251  protein of unknown function DUF86  31.08 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.414648 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1589  hypothetical protein  26.44 
 
 		 145 aa  40  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>