40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0759 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_0759  hypothetical protein  100 
 
 
141 aa  292  1e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.17486  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1440  hypothetical protein  56.62 
 
 
252 aa  147  5e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1762  hypothetical protein  55.15 
 
 
276 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.254099  normal  0.270022 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1792  hypothetical protein  54.41 
 
 
295 aa  144  6e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.210053 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3045  hypothetical protein  38.81 
 
 
142 aa  100  6e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.161016  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0761  hypothetical protein  38.35 
 
 
145 aa  88.2  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0131457  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1314  hypothetical protein  36.04 
 
 
142 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2568  protein of unknown function DUF86  32.29 
 
 
140 aa  50.4  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4417  hypothetical protein  34.52 
 
 
137 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.126362 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2344  protein of unknown function DUF86  37.11 
 
 
140 aa  49.3  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0224  protein of unknown function DUF86  30.28 
 
 
130 aa  48.5  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3258  hypothetical protein  31.18 
 
 
139 aa  48.1  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115451  hitchhiker  2.57897e-16 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0762  hypothetical protein  33.04 
 
 
137 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.120748 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2562  protein of unknown function DUF86  30.17 
 
 
138 aa  46.2  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0997  protein of unknown function DUF86  36 
 
 
115 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0512778 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0216  hypothetical protein  26.85 
 
 
141 aa  43.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0179  hypothetical protein  37.68 
 
 
128 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00352921  normal  0.908992 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2671  hypothetical protein  31.58 
 
 
119 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.850866  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0169  ISSod9 hypothetical protein  30.93 
 
 
125 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.194296  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0018  ISSod9 hypothetical protein  30.93 
 
 
125 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.231151  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0505  hypothetical protein  30.69 
 
 
115 aa  43.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0659  hypothetical protein  30.77 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000879573  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0868  protein of unknown function DUF86  29.7 
 
 
115 aa  42.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0324  hypothetical protein  29.21 
 
 
135 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1202  hypothetical protein  42.55 
 
 
115 aa  42.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0520235  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0604  hypothetical protein  33.85 
 
 
129 aa  42.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0275  hypothetical protein  41.86 
 
 
110 aa  42.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2451  hypothetical protein  28.74 
 
 
115 aa  42.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000252259  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1474  protein of unknown function DUF86  40 
 
 
113 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.173165  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1813  hypothetical protein  28.41 
 
 
122 aa  41.2  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.691748  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3254  protein of unknown function DUF86  29.35 
 
 
140 aa  41.2  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3785  protein of unknown function DUF86  47.22 
 
 
115 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.129087  normal  0.515713 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1804  protein of unknown function DUF86  33.33 
 
 
114 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0032  hypothetical protein  39.53 
 
 
117 aa  40.8  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.89444  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1229  hypothetical protein  51.72 
 
 
117 aa  40.8  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.949454  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1083  protein of unknown function DUF86  52 
 
 
83 aa  40.8  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.15449  normal  0.384095 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2733  protein of unknown function DUF86  31.33 
 
 
138 aa  40.8  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.226128  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0295  protein of unknown function DUF86  36.96 
 
 
116 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.603584 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0480  hypothetical protein  38.3 
 
 
116 aa  40.4  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2758  hypothetical protein  40 
 
 
118 aa  40.4  0.008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>