64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1815 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1815  hypothetical protein  100 
 
 
137 aa  281  3.0000000000000004e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000107502  normal  0.591641 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1971  protein of unknown function DUF86  81.62 
 
 
136 aa  226  8e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.190961 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1588  protein of unknown function DUF86  62.96 
 
 
138 aa  182  9e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.181939  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0768  hypothetical protein  63.64 
 
 
139 aa  181  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0767  hypothetical protein  63.64 
 
 
139 aa  181  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1470  protein of unknown function DUF86  62.12 
 
 
139 aa  178  2e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.35466  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2333  hypothetical protein  57.58 
 
 
136 aa  151  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1862  hypothetical protein  37.69 
 
 
139 aa  92.4  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0270  hypothetical protein  33.82 
 
 
147 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2423  hypothetical protein  39.42 
 
 
135 aa  87.8  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5680  hypothetical protein  33.82 
 
 
137 aa  87.4  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0684551  hitchhiker  0.00143143 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0894  hypothetical protein  37.21 
 
 
139 aa  85.1  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3166  hypothetical protein  34.92 
 
 
133 aa  83.6  8e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2344  protein of unknown function DUF86  34.88 
 
 
140 aa  79.7  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3254  protein of unknown function DUF86  43.43 
 
 
140 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2953  hypothetical protein  30.37 
 
 
146 aa  76.3  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2947  hypothetical protein  33.33 
 
 
140 aa  76.6  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2977  protein of unknown function DUF86  33.33 
 
 
140 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0134  hypothetical protein  32.54 
 
 
142 aa  72.8  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2568  protein of unknown function DUF86  36.47 
 
 
140 aa  71.2  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1074  hypothetical protein  31.2 
 
 
143 aa  70.9  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.673636  normal  0.243145 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1396  protein of unknown function DUF86  38.54 
 
 
144 aa  70.9  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026346  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1251  protein of unknown function DUF86  34.82 
 
 
141 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.414648 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1671  protein of unknown function DUF86  28.46 
 
 
139 aa  68.6  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1275  hypothetical protein  29.6 
 
 
140 aa  66.6  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000365533 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2629  protein of unknown function DUF86  42.65 
 
 
85 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.436875  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0179  hypothetical protein  34.15 
 
 
128 aa  66.2  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00352921  normal  0.908992 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1589  hypothetical protein  35.05 
 
 
145 aa  62.4  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0128  protein of unknown function DUF86  33.68 
 
 
140 aa  59.7  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00082454  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0659  hypothetical protein  27.78 
 
 
140 aa  59.3  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000879573  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4529  hypothetical protein  29.6 
 
 
132 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.249791  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3258  hypothetical protein  29.37 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115451  hitchhiker  2.57897e-16 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1667  protein of unknown function DUF86  27.5 
 
 
139 aa  57.8  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2972  hypothetical protein  61.54 
 
 
46 aa  57.8  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1945  hypothetical protein  28.91 
 
 
131 aa  57.4  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.755475  normal  0.160304 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4098  hypothetical protein  36.36 
 
 
135 aa  56.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272071  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3016  hypothetical protein  29.21 
 
 
131 aa  53.5  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0210  hypothetical protein  38.16 
 
 
144 aa  53.5  0.0000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.281123  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0761  hypothetical protein  35.23 
 
 
145 aa  53.1  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0131457  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0073  hypothetical protein  31.91 
 
 
112 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.483504  normal  0.176783 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1106  hypothetical protein  28.18 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00999093  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3045  hypothetical protein  34.58 
 
 
142 aa  52  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.161016  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0363  hypothetical protein  31.76 
 
 
139 aa  51.2  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0186  hypothetical protein  26.45 
 
 
149 aa  51.2  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.894445 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0224  protein of unknown function DUF86  30.68 
 
 
130 aa  50.8  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1679  hypothetical protein  30.86 
 
 
143 aa  48.9  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000033772  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2243  hypothetical protein  30.77 
 
 
146 aa  48.5  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.125397  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0544  hypothetical protein  27.13 
 
 
145 aa  48.1  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00745715  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2194  protein of unknown function DUF86  26.92 
 
 
143 aa  47.8  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000224954  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3653  hypothetical protein  32.5 
 
 
137 aa  47  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.352214  normal  0.739112 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0770  hypothetical protein  25.49 
 
 
143 aa  47  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.465688 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1317  hypothetical protein  23.85 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0319  hypothetical protein  36.76 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1792  hypothetical protein  31.87 
 
 
295 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.210053 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0245  protein of unknown function DUF86  29.52 
 
 
141 aa  44.7  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2733  protein of unknown function DUF86  30.59 
 
 
138 aa  44.3  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.226128  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2316  hypothetical protein  32.95 
 
 
105 aa  43.9  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0239991  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4417  hypothetical protein  32.14 
 
 
137 aa  43.5  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.126362 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1951  protein of unknown function DUF86  28.4 
 
 
149 aa  42.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1769  hypothetical protein  25 
 
 
292 aa  42.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.026632  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0324  hypothetical protein  32.88 
 
 
135 aa  41.6  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0762  hypothetical protein  29.09 
 
 
137 aa  41.6  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.120748 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1224  protein of unknown function DUF86  25.19 
 
 
142 aa  41.2  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1762  hypothetical protein  29.67 
 
 
276 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.254099  normal  0.270022 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>