54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0073 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0073  hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  228  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.483504  normal  0.176783 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1106  hypothetical protein  78.43 
 
 		 144 aa  164  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00999093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0179  hypothetical protein  59.22 
 
 		 128 aa  137  6e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00352921  normal  0.908992 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2243  hypothetical protein  34 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.125397  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0210  hypothetical protein  37.5 
 
 		 144 aa  67  0.00000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.281123  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0216  hypothetical protein  29.52 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3653  hypothetical protein  36.84 
 
 		 137 aa  63.5  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.352214  normal  0.739112 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2164  hypothetical protein  28.3 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1951  protein of unknown function DUF86  39.39 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0770  hypothetical protein  36.59 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465688 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1862  hypothetical protein  37.14 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3016  hypothetical protein  33.33 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0363  hypothetical protein  35.96 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1470  protein of unknown function DUF86  31 
 
 		 139 aa  57  0.00000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.35466  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2194  protein of unknown function DUF86  27.68 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000224954  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1588  protein of unknown function DUF86  31.78 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.181939  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1317  hypothetical protein  33.01 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3258  hypothetical protein  27.88 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115451  hitchhiker  2.57897e-16 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1769  hypothetical protein  29.52 
 
 		 292 aa  54.7  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.026632  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2977  protein of unknown function DUF86  34.62 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1815  hypothetical protein  31.91 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000107502  normal  0.591641 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0768  hypothetical protein  28 
 
 		 139 aa  52.8  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4098  hypothetical protein  34.74 
 
 		 135 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0767  hypothetical protein  28 
 
 		 139 aa  52.8  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1671  protein of unknown function DUF86  33.98 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2568  protein of unknown function DUF86  28.04 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0128  protein of unknown function DUF86  32.41 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00082454  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  31.13 
 
 		 271 aa  52.4  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0186  hypothetical protein  28.44 
 
 		 149 aa  51.6  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.894445 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1224  protein of unknown function DUF86  34.31 
 
 		 142 aa  51.6  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1589  hypothetical protein  27.43 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4529  hypothetical protein  34.09 
 
 		 132 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.249791  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0224  protein of unknown function DUF86  25.71 
 
 		 130 aa  50.8  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1762  hypothetical protein  28 
 
 		 276 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.254099  normal  0.270022 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1251  protein of unknown function DUF86  31.73 
 
 		 141 aa  47.8  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.414648 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3254  protein of unknown function DUF86  31.37 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2333  hypothetical protein  28.57 
 
 		 136 aa  47.4  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0319  hypothetical protein  33.98 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0270  hypothetical protein  30.61 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1971  protein of unknown function DUF86  27.37 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.190961 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2316  hypothetical protein  33.33 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0239991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0245  protein of unknown function DUF86  28.28 
 
 		 141 aa  45.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0546  protein of unknown function DUF86  29 
 
 		 151 aa  45.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000598911  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3166  hypothetical protein  27.72 
 
 		 133 aa  44.7  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1311  hypothetical protein  26.79 
 
 		 141 aa  44.7  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1440  hypothetical protein  36.62 
 
 		 252 aa  43.9  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1792  hypothetical protein  31.63 
 
 		 295 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210053 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0659  hypothetical protein  25.93 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000879573  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5680  hypothetical protein  28.3 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0684551  hitchhiker  0.00143143 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4417  hypothetical protein  28.57 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.126362 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1370  DNA polymerase beta subunit  29.7 
 
 		 241 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0334218 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1396  protein of unknown function DUF86  27.96 
 
 		 144 aa  42  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026346  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2953  hypothetical protein  29.67 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2344  protein of unknown function DUF86  28.16 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>