37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1945 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1945  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  268  2e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.755475  normal  0.160304 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2953  hypothetical protein  71.43 
 
 		 146 aa  174  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0270  hypothetical protein  37.61 
 
 		 147 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5680  hypothetical protein  36.75 
 
 		 137 aa  92.4  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0684551  hitchhiker  0.00143143 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0894  hypothetical protein  41.53 
 
 		 139 aa  87.8  5e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2344  protein of unknown function DUF86  34.4 
 
 		 140 aa  85.1  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3166  hypothetical protein  34.4 
 
 		 133 aa  82  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2423  hypothetical protein  34.43 
 
 		 135 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0134  hypothetical protein  37.82 
 
 		 142 aa  81.6  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2947  hypothetical protein  35.88 
 
 		 140 aa  76.6  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1396  protein of unknown function DUF86  34.65 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026346  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1074  hypothetical protein  34.92 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.673636  normal  0.243145 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1275  hypothetical protein  36.13 
 
 		 140 aa  73.9  0.0000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000365533 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2333  hypothetical protein  34.75 
 
 		 136 aa  67.8  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1588  protein of unknown function DUF86  31.25 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.181939  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3254  protein of unknown function DUF86  33.02 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0768  hypothetical protein  31.25 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0767  hypothetical protein  31.25 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2977  protein of unknown function DUF86  30.89 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1971  protein of unknown function DUF86  29.69 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.190961 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1815  hypothetical protein  28.91 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000107502  normal  0.591641 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1470  protein of unknown function DUF86  34.02 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.35466  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3258  hypothetical protein  26.98 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115451  hitchhiker  2.57897e-16 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1671  protein of unknown function DUF86  26.92 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0224  protein of unknown function DUF86  27.06 
 
 		 130 aa  50.8  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2568  protein of unknown function DUF86  27.16 
 
 		 140 aa  50.8  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1862  hypothetical protein  23.85 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0659  hypothetical protein  24.41 
 
 		 140 aa  47.4  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000879573  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1589  hypothetical protein  30.77 
 
 		 145 aa  44.3  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0186  hypothetical protein  31.37 
 
 		 149 aa  43.9  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.894445 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0210  hypothetical protein  32.94 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.281123  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4417  hypothetical protein  32.14 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.126362 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1667  protein of unknown function DUF86  23.08 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0179  hypothetical protein  30.34 
 
 		 128 aa  40.8  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00352921  normal  0.908992 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2629  protein of unknown function DUF86  31.03 
 
 		 85 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.436875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2243  hypothetical protein  22.22 
 
 		 146 aa  40.4  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.125397  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1679  hypothetical protein  30.59 
 
 		 143 aa  40  0.01  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000033772  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>