62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1275 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1275  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  283  7e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000365533 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0134  hypothetical protein  74.82 
 
 		 142 aa  212  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1074  hypothetical protein  72.46 
 
 		 143 aa  207  5e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.673636  normal  0.243145 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2947  hypothetical protein  70.8 
 
 		 140 aa  205  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0894  hypothetical protein  52.17 
 
 		 139 aa  149  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3166  hypothetical protein  50 
 
 		 133 aa  140  5e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2423  hypothetical protein  47.76 
 
 		 135 aa  140  8e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5680  hypothetical protein  47.37 
 
 		 137 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0684551  hitchhiker  0.00143143 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0270  hypothetical protein  46.62 
 
 		 147 aa  137  7e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1396  protein of unknown function DUF86  46.32 
 
 		 144 aa  132  9.999999999999999e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026346  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2977  protein of unknown function DUF86  45.11 
 
 		 140 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1251  protein of unknown function DUF86  43.28 
 
 		 141 aa  122  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.414648 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2344  protein of unknown function DUF86  42.86 
 
 		 140 aa  121  3e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2953  hypothetical protein  38.46 
 
 		 146 aa  94  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1588  protein of unknown function DUF86  33.33 
 
 		 138 aa  90.1  8e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.181939  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2333  hypothetical protein  37.6 
 
 		 136 aa  89.7  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0767  hypothetical protein  33.06 
 
 		 139 aa  86.3  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0768  hypothetical protein  33.06 
 
 		 139 aa  86.3  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1470  protein of unknown function DUF86  32.26 
 
 		 139 aa  84.7  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.35466  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3258  hypothetical protein  34.15 
 
 		 139 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115451  hitchhiker  2.57897e-16 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1945  hypothetical protein  36.13 
 
 		 131 aa  73.9  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.755475  normal  0.160304 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1971  protein of unknown function DUF86  31.75 
 
 		 136 aa  72.8  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.190961 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0659  hypothetical protein  34.74 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000879573  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1815  hypothetical protein  29.6 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000107502  normal  0.591641 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1862  hypothetical protein  30.77 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2629  protein of unknown function DUF86  45.59 
 
 		 85 aa  65.5  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.436875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2733  protein of unknown function DUF86  40.21 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.226128  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3254  protein of unknown function DUF86  30 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0224  protein of unknown function DUF86  33.33 
 
 		 130 aa  60.1  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2243  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.125397  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4529  hypothetical protein  31.4 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.249791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4417  hypothetical protein  28.1 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.126362 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1671  protein of unknown function DUF86  28.04 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2568  protein of unknown function DUF86  32.22 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1667  protein of unknown function DUF86  25 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1679  hypothetical protein  35.63 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000033772  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0186  hypothetical protein  30 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.894445 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  37.97 
 
 		 271 aa  52.8  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1589  hypothetical protein  33.33 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0762  hypothetical protein  26.89 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.120748 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0393  hypothetical protein  28.97 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.109457  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0245  protein of unknown function DUF86  28.42 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0770  hypothetical protein  33.65 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465688 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1769  hypothetical protein  27.21 
 
 		 292 aa  44.7  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.026632  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2562  protein of unknown function DUF86  29.33 
 
 		 138 aa  44.3  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0363  hypothetical protein  27 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1317  hypothetical protein  25.74 
 
 		 138 aa  44.3  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0210  hypothetical protein  30 
 
 		 144 aa  43.9  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.281123  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0546  protein of unknown function DUF86  31.58 
 
 		 151 aa  42.7  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000598911  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3016  hypothetical protein  35.59 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0128  protein of unknown function DUF86  23.58 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00082454  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1792  hypothetical protein  32.5 
 
 		 295 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210053 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1403  hypothetical protein  25 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0680673  normal  0.202766 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0429  hypothetical protein  28.24 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0671683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1224  protein of unknown function DUF86  29.91 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0179  hypothetical protein  24.47 
 
 		 128 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00352921  normal  0.908992 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2107  hypothetical protein  29.41 
 
 		 138 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0461455  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1762  hypothetical protein  31.25 
 
 		 276 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.254099  normal  0.270022 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1440  hypothetical protein  32.5 
 
 		 252 aa  40.8  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4098  hypothetical protein  31.82 
 
 		 135 aa  40.4  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2280  hypothetical protein  43.24 
 
 		 51 aa  40.4  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00520826  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3653  hypothetical protein  34.88 
 
 		 137 aa  40.4  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.352214  normal  0.739112 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>