21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2107 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2107  hypothetical protein  100 
 
 
138 aa  280  5.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0461455  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3653  hypothetical protein  40.6 
 
 
137 aa  90.9  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.352214  normal  0.739112 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4098  hypothetical protein  37.59 
 
 
135 aa  86.3  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272071  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2164  hypothetical protein  30.84 
 
 
142 aa  60.5  0.000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0659  hypothetical protein  31.03 
 
 
140 aa  53.9  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000879573  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2568  protein of unknown function DUF86  26.4 
 
 
140 aa  51.2  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0210  hypothetical protein  31.31 
 
 
144 aa  50.1  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.281123  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3258  hypothetical protein  27.61 
 
 
139 aa  50.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115451  hitchhiker  2.57897e-16 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2243  hypothetical protein  25.53 
 
 
146 aa  49.7  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.125397  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0216  hypothetical protein  27.64 
 
 
141 aa  49.3  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2947  hypothetical protein  33.72 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1224  protein of unknown function DUF86  24.62 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1396  protein of unknown function DUF86  32.14 
 
 
144 aa  46.2  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026346  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1589  hypothetical protein  30.53 
 
 
145 aa  45.4  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2562  protein of unknown function DUF86  25.66 
 
 
138 aa  45.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0134  hypothetical protein  29.07 
 
 
142 aa  43.9  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0946  hypothetical protein  24.39 
 
 
144 aa  43.5  0.0009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0927  hypothetical protein  24.39 
 
 
144 aa  43.5  0.0009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.472953  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1074  hypothetical protein  30.38 
 
 
143 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.673636  normal  0.243145 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1275  hypothetical protein  29.41 
 
 
140 aa  42  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000365533 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3046  protein of unknown function DUF86  28.12 
 
 
145 aa  40.4  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>