57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4098 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4098  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  268  1e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3653  hypothetical protein  83.7 
 
 		 137 aa  228  3e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.352214  normal  0.739112 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2107  hypothetical protein  37.59 
 
 		 138 aa  86.3  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0461455  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2423  hypothetical protein  35.66 
 
 		 135 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2568  protein of unknown function DUF86  27.74 
 
 		 140 aa  72  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0270  hypothetical protein  32.81 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2164  hypothetical protein  31.25 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5680  hypothetical protein  32.03 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0684551  hitchhiker  0.00143143 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3258  hypothetical protein  33.87 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115451  hitchhiker  2.57897e-16 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0894  hypothetical protein  35.66 
 
 		 139 aa  62  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1971  protein of unknown function DUF86  36.25 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.190961 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0659  hypothetical protein  31.01 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000879573  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3166  hypothetical protein  30.08 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0216  hypothetical protein  30.3 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2977  protein of unknown function DUF86  29.63 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1815  hypothetical protein  36.36 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000107502  normal  0.591641 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0363  hypothetical protein  31.78 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1588  protein of unknown function DUF86  32.98 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.181939  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2243  hypothetical protein  23.57 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.125397  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0073  hypothetical protein  34.74 
 
 		 112 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.483504  normal  0.176783 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1251  protein of unknown function DUF86  40.32 
 
 		 141 aa  52.8  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.414648 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1589  hypothetical protein  32.17 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1396  protein of unknown function DUF86  29.05 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026346  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1470  protein of unknown function DUF86  29.79 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.35466  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0767  hypothetical protein  30.85 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0768  hypothetical protein  30.85 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0179  hypothetical protein  31.71 
 
 		 128 aa  51.6  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00352921  normal  0.908992 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2629  protein of unknown function DUF86  38.71 
 
 		 85 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.436875  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0224  protein of unknown function DUF86  22.48 
 
 		 130 aa  50.4  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2947  hypothetical protein  31.62 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2344  protein of unknown function DUF86  35 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1106  hypothetical protein  30.47 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00999093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0210  hypothetical protein  40.85 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.281123  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1769  hypothetical protein  31.76 
 
 		 292 aa  49.3  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.026632  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3016  hypothetical protein  33.61 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2953  hypothetical protein  31.4 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0134  hypothetical protein  32.31 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2333  hypothetical protein  32.58 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1317  hypothetical protein  36.62 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0245  protein of unknown function DUF86  29.01 
 
 		 141 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0319  hypothetical protein  38.81 
 
 		 142 aa  47  0.00008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1679  hypothetical protein  35.63 
 
 		 143 aa  46.2  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000033772  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1862  hypothetical protein  31.71 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4417  hypothetical protein  28.8 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.126362 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2194  protein of unknown function DUF86  25.56 
 
 		 143 aa  45.4  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000224954  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0186  hypothetical protein  26.92 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.894445 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1074  hypothetical protein  30.6 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.673636  normal  0.243145 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0770  hypothetical protein  30.77 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465688 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1762  hypothetical protein  31.68 
 
 		 276 aa  42.7  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.254099  normal  0.270022 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0762  hypothetical protein  28.03 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.120748 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3045  hypothetical protein  33.33 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.161016  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3254  protein of unknown function DUF86  23.81 
 
 		 140 aa  41.2  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0544  hypothetical protein  27.55 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00745715  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2733  protein of unknown function DUF86  32.65 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.226128  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1275  hypothetical protein  31.82 
 
 		 140 aa  40.4  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000365533 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1792  hypothetical protein  30.89 
 
 		 295 aa  40  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210053 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0128  protein of unknown function DUF86  25 
 
 		 140 aa  40  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00082454  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>