68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2947 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2947  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  281  2.0000000000000002e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0134  hypothetical protein  77.3 
 
 
142 aa  231  3e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1074  hypothetical protein  73.68 
 
 
143 aa  217  5e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.673636  normal  0.243145 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1275  hypothetical protein  70.8 
 
 
140 aa  205  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000365533 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0894  hypothetical protein  55.15 
 
 
139 aa  155  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2423  hypothetical protein  51.13 
 
 
135 aa  150  5e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5680  hypothetical protein  51.88 
 
 
137 aa  149  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0684551  hitchhiker  0.00143143 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0270  hypothetical protein  50.38 
 
 
147 aa  149  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3166  hypothetical protein  50.81 
 
 
133 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2344  protein of unknown function DUF86  50.38 
 
 
140 aa  135  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1396  protein of unknown function DUF86  48.46 
 
 
144 aa  136  1e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026346  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2977  protein of unknown function DUF86  46.56 
 
 
140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1251  protein of unknown function DUF86  45.31 
 
 
141 aa  118  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.414648 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1588  protein of unknown function DUF86  36.8 
 
 
138 aa  99.8  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.181939  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2953  hypothetical protein  38.81 
 
 
146 aa  95.5  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0767  hypothetical protein  36.29 
 
 
139 aa  92  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0768  hypothetical protein  36.29 
 
 
139 aa  92  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2333  hypothetical protein  38.02 
 
 
136 aa  89.7  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1470  protein of unknown function DUF86  33.87 
 
 
139 aa  85.1  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.35466  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1971  protein of unknown function DUF86  34.4 
 
 
136 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.190961 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2629  protein of unknown function DUF86  56.72 
 
 
85 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.436875  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1815  hypothetical protein  33.33 
 
 
137 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000107502  normal  0.591641 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1945  hypothetical protein  35.88 
 
 
131 aa  76.6  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.755475  normal  0.160304 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3258  hypothetical protein  43.33 
 
 
139 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115451  hitchhiker  2.57897e-16 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1679  hypothetical protein  38.39 
 
 
143 aa  72  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000033772  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2733  protein of unknown function DUF86  40.4 
 
 
138 aa  70.9  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.226128  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0659  hypothetical protein  40 
 
 
140 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000879573  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4529  hypothetical protein  33.9 
 
 
132 aa  67.8  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.249791  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1862  hypothetical protein  32.11 
 
 
139 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2243  hypothetical protein  30.77 
 
 
146 aa  64.3  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.125397  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2562  protein of unknown function DUF86  33.62 
 
 
138 aa  64.3  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1667  protein of unknown function DUF86  28.46 
 
 
139 aa  63.9  0.0000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3254  protein of unknown function DUF86  31.48 
 
 
140 aa  63.9  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0224  protein of unknown function DUF86  35.8 
 
 
130 aa  58.9  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1589  hypothetical protein  35.24 
 
 
145 aa  58.2  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1671  protein of unknown function DUF86  28.83 
 
 
139 aa  57.4  0.00000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4417  hypothetical protein  26.77 
 
 
137 aa  57  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.126362 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2568  protein of unknown function DUF86  34.12 
 
 
140 aa  57  0.00000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0245  protein of unknown function DUF86  31.31 
 
 
141 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0186  hypothetical protein  27.87 
 
 
149 aa  53.5  0.0000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.894445 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0762  hypothetical protein  31.58 
 
 
137 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.120748 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  38.96 
 
 
271 aa  51.2  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0544  hypothetical protein  30.61 
 
 
145 aa  50.4  0.000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00745715  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0770  hypothetical protein  34.04 
 
 
143 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.465688 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4098  hypothetical protein  31.62 
 
 
135 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272071  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3016  hypothetical protein  28.45 
 
 
131 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1403  hypothetical protein  29.63 
 
 
149 aa  48.5  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0680673  normal  0.202766 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3653  hypothetical protein  32.09 
 
 
137 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.352214  normal  0.739112 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2107  hypothetical protein  33.72 
 
 
138 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0461455  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0128  protein of unknown function DUF86  25.4 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00082454  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1769  hypothetical protein  28.68 
 
 
292 aa  48.1  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.026632  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1224  protein of unknown function DUF86  25.78 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0210  hypothetical protein  32 
 
 
144 aa  45.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.281123  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0363  hypothetical protein  28.15 
 
 
139 aa  46.2  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3045  hypothetical protein  31.25 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.161016  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0546  protein of unknown function DUF86  31.18 
 
 
151 aa  45.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000598911  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0393  hypothetical protein  28.87 
 
 
142 aa  45.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.109457  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0179  hypothetical protein  24.79 
 
 
128 aa  44.7  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00352921  normal  0.908992 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2972  hypothetical protein  46.15 
 
 
46 aa  43.9  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0429  hypothetical protein  26.67 
 
 
141 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0671683  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1317  hypothetical protein  23.02 
 
 
138 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1792  hypothetical protein  27.27 
 
 
295 aa  42  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.210053 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2164  hypothetical protein  25.23 
 
 
142 aa  41.6  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1762  hypothetical protein  26.14 
 
 
276 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.254099  normal  0.270022 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0319  hypothetical protein  32.31 
 
 
142 aa  40.4  0.008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1202  protein of unknown function DUF86  25.66 
 
 
113 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0761  hypothetical protein  29.73 
 
 
145 aa  40  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0131457  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2280  hypothetical protein  45.95 
 
 
51 aa  40  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00520826  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>