58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3016 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3016  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  264  2.9999999999999995e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4529  hypothetical protein  65.65 
 
 		 132 aa  180  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.249791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0527  protein of unknown function DUF86  29.01 
 
 		 133 aa  82.4  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0363  hypothetical protein  36.72 
 
 		 139 aa  77  0.00000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2243  hypothetical protein  31.06 
 
 		 146 aa  73.2  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.125397  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0179  hypothetical protein  34.86 
 
 		 128 aa  72  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00352921  normal  0.908992 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0270  hypothetical protein  42.35 
 
 		 147 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1671  protein of unknown function DUF86  28.24 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2423  hypothetical protein  33.03 
 
 		 135 aa  67.4  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5680  hypothetical protein  32.48 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0684551  hitchhiker  0.00143143 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1971  protein of unknown function DUF86  31.46 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.190961 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1470  protein of unknown function DUF86  31.52 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.35466  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0073  hypothetical protein  33.33 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.483504  normal  0.176783 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2344  protein of unknown function DUF86  35.29 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1667  protein of unknown function DUF86  31.58 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0186  hypothetical protein  33.94 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.894445 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1589  hypothetical protein  27.27 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0224  protein of unknown function DUF86  26.79 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0210  hypothetical protein  33.67 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.281123  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0768  hypothetical protein  29.35 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0767  hypothetical protein  29.35 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4417  hypothetical protein  30.53 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.126362 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1588  protein of unknown function DUF86  28.26 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.181939  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2977  protein of unknown function DUF86  33.33 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2333  hypothetical protein  31.46 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1815  hypothetical protein  29.21 
 
 		 137 aa  53.5  0.0000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000107502  normal  0.591641 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0770  hypothetical protein  29.46 
 
 		 143 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465688 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0128  protein of unknown function DUF86  29.29 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00082454  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1679  hypothetical protein  34.57 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000033772  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3166  hypothetical protein  26.27 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2953  hypothetical protein  37.08 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1862  hypothetical protein  29.9 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0894  hypothetical protein  35.56 
 
 		 139 aa  51.6  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0319  hypothetical protein  30.3 
 
 		 142 aa  51.2  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3653  hypothetical protein  33.63 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.352214  normal  0.739112 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0245  protein of unknown function DUF86  30.34 
 
 		 141 aa  50.4  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1251  protein of unknown function DUF86  30.11 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.414648 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3254  protein of unknown function DUF86  32.22 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2947  hypothetical protein  28.45 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  33.33 
 
 		 271 aa  49.3  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1106  hypothetical protein  28.43 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00999093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0762  hypothetical protein  28.91 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.120748 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4098  hypothetical protein  33.61 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1396  protein of unknown function DUF86  32.22 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026346  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3258  hypothetical protein  27.69 
 
 		 139 aa  47  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115451  hitchhiker  2.57897e-16 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1224  protein of unknown function DUF86  33.33 
 
 		 142 aa  45.4  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0546  protein of unknown function DUF86  29.92 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000598911  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1769  hypothetical protein  26.92 
 
 		 292 aa  44.7  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.026632  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0544  hypothetical protein  28.24 
 
 		 145 aa  43.9  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00745715  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2733  protein of unknown function DUF86  31.71 
 
 		 138 aa  43.9  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.226128  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1026  hypothetical protein  32.95 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.304119  normal  0.375352 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1275  hypothetical protein  35.59 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000365533 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1317  hypothetical protein  26.79 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2316  hypothetical protein  35.21 
 
 		 105 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0239991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0134  hypothetical protein  24.14 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2629  protein of unknown function DUF86  30.67 
 
 		 85 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.436875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1074  hypothetical protein  28.24 
 
 		 143 aa  42  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.673636  normal  0.243145 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2901  protein of unknown function DUF86  25.76 
 
 		 145 aa  40  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>