62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2953 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2953  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  294  3e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1945  hypothetical protein  71.43 
 
 		 131 aa  174  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.755475  normal  0.160304 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0270  hypothetical protein  42.11 
 
 		 147 aa  124  5e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5680  hypothetical protein  40.15 
 
 		 137 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0684551  hitchhiker  0.00143143 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2423  hypothetical protein  36.64 
 
 		 135 aa  103  5e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2344  protein of unknown function DUF86  38.41 
 
 		 140 aa  103  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0894  hypothetical protein  45.08 
 
 		 139 aa  99  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3166  hypothetical protein  37.9 
 
 		 133 aa  98.6  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1074  hypothetical protein  38.06 
 
 		 143 aa  97.8  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.673636  normal  0.243145 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0134  hypothetical protein  37.69 
 
 		 142 aa  97.8  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2947  hypothetical protein  38.81 
 
 		 140 aa  95.5  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1275  hypothetical protein  38.46 
 
 		 140 aa  94  6e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000365533 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3254  protein of unknown function DUF86  37.6 
 
 		 140 aa  91.3  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2333  hypothetical protein  37.1 
 
 		 136 aa  89.7  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1396  protein of unknown function DUF86  40 
 
 		 144 aa  89.4  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026346  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1588  protein of unknown function DUF86  31.11 
 
 		 138 aa  83.6  8e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.181939  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0768  hypothetical protein  37.37 
 
 		 139 aa  80.5  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0767  hypothetical protein  37.37 
 
 		 139 aa  80.5  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1470  protein of unknown function DUF86  37.89 
 
 		 139 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.35466  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1971  protein of unknown function DUF86  36.27 
 
 		 136 aa  77.4  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.190961 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2977  protein of unknown function DUF86  36.59 
 
 		 140 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1815  hypothetical protein  30.37 
 
 		 137 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000107502  normal  0.591641 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3258  hypothetical protein  32.09 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115451  hitchhiker  2.57897e-16 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1671  protein of unknown function DUF86  31.11 
 
 		 139 aa  75.5  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0659  hypothetical protein  29.71 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000879573  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1589  hypothetical protein  38.14 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1251  protein of unknown function DUF86  32.54 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.414648 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1862  hypothetical protein  27.91 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1667  protein of unknown function DUF86  30.71 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2243  hypothetical protein  36.9 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.125397  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0224  protein of unknown function DUF86  32.14 
 
 		 130 aa  60.1  0.000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0210  hypothetical protein  35 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.281123  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0546  protein of unknown function DUF86  25.35 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000598911  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0393  hypothetical protein  26.12 
 
 		 142 aa  57  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.109457  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2568  protein of unknown function DUF86  29.76 
 
 		 140 aa  57  0.00000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4417  hypothetical protein  28.57 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.126362 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1679  hypothetical protein  35.05 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000033772  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0128  protein of unknown function DUF86  26.43 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00082454  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0186  hypothetical protein  37.35 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.894445 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2733  protein of unknown function DUF86  34.04 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.226128  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2629  protein of unknown function DUF86  37.88 
 
 		 85 aa  54.3  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.436875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1311  hypothetical protein  30.34 
 
 		 141 aa  53.5  0.0000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3016  hypothetical protein  37.08 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0762  hypothetical protein  35.71 
 
 		 137 aa  50.4  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.120748 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1769  hypothetical protein  27.21 
 
 		 292 aa  50.1  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.026632  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0179  hypothetical protein  30 
 
 		 128 aa  49.7  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00352921  normal  0.908992 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3653  hypothetical protein  30.33 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.352214  normal  0.739112 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4529  hypothetical protein  32.2 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.249791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4098  hypothetical protein  31.4 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0363  hypothetical protein  36.47 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1106  hypothetical protein  34.09 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00999093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1082  hypothetical protein  35.77 
 
 		 256 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.167925  normal  0.321857 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2562  protein of unknown function DUF86  27.17 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0544  hypothetical protein  29.67 
 
 		 145 aa  44.3  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00745715  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2194  protein of unknown function DUF86  24.72 
 
 		 143 aa  41.6  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000224954  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1534  hypothetical protein  30.34 
 
 		 101 aa  42  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1317  hypothetical protein  26.83 
 
 		 138 aa  41.2  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1224  protein of unknown function DUF86  26.36 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2164  hypothetical protein  26.92 
 
 		 142 aa  41.2  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0073  hypothetical protein  29.67 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.483504  normal  0.176783 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3045  hypothetical protein  32.43 
 
 		 142 aa  40.4  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.161016  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0319  hypothetical protein  31.03 
 
 		 142 aa  40.4  0.008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>