17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1082 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1082  hypothetical protein  100 
 
 
256 aa  508  1e-143  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.167925  normal  0.321857 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1900  hypothetical protein  48.78 
 
 
250 aa  209  4e-53  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1535  paREP11  69.64 
 
 
114 aa  160  2e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.92809 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1534  hypothetical protein  68.32 
 
 
101 aa  144  2e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1370  DNA polymerase beta subunit  33.88 
 
 
241 aa  72  0.000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0334218 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  32 
 
 
271 aa  66.2  0.0000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1410  paREP11  32.04 
 
 
172 aa  53.9  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.345052  normal  0.266454 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1422  DNA polymerase beta subunit  43.48 
 
 
123 aa  50.8  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.747879  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1589  hypothetical protein  33.08 
 
 
145 aa  49.3  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0323  hypothetical protein  36.96 
 
 
134 aa  48.1  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2243  hypothetical protein  33.78 
 
 
146 aa  47.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.125397  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2953  hypothetical protein  35.77 
 
 
146 aa  45.8  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0474  hypothetical protein  38.1 
 
 
134 aa  43.1  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.763339  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1093  hypothetical protein  45.45 
 
 
137 aa  43.5  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0210  hypothetical protein  37.36 
 
 
144 aa  42.4  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.281123  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1671  protein of unknown function DUF86  28 
 
 
139 aa  42.4  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3749  hypothetical protein  38.37 
 
 
135 aa  42  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>