13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1093 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1093  hypothetical protein  100 
 
 
137 aa  274  2e-73  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0323  hypothetical protein  43.65 
 
 
134 aa  91.3  4e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1533  hypothetical protein  41.86 
 
 
137 aa  84  7e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.959359  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0556  hypothetical protein  41.86 
 
 
137 aa  83.6  8e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0112545  hitchhiker  0.00000236573 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0943  DNA polymerase beta subunit  34.81 
 
 
136 aa  65.1  0.0000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.31536  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0474  hypothetical protein  35.11 
 
 
134 aa  59.7  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.763339  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1600  hypothetical protein  35.38 
 
 
132 aa  58.5  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1102  hypothetical protein  26.19 
 
 
139 aa  47.8  0.00005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.431617 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1900  hypothetical protein  37.8 
 
 
250 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1668  DNA polymerase beta domain protein region  40.82 
 
 
146 aa  46.6  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0494  hypothetical protein  28.07 
 
 
129 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1535  paREP11  45.45 
 
 
114 aa  41.2  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.92809 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0899  hypothetical protein  38.46 
 
 
69 aa  40.8  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>