11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0474 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0474  hypothetical protein  100 
 
 
134 aa  272  9e-73  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.763339  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0943  DNA polymerase beta subunit  48.84 
 
 
136 aa  105  2e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.31536  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1600  hypothetical protein  46.34 
 
 
132 aa  93.2  1e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0323  hypothetical protein  40.91 
 
 
134 aa  87.4  6e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1533  hypothetical protein  44.25 
 
 
137 aa  74.3  0.0000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.959359  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0556  hypothetical protein  43.36 
 
 
137 aa  72.8  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0112545  hitchhiker  0.00000236573 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1093  hypothetical protein  35.11 
 
 
137 aa  59.7  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1410  paREP11  40.82 
 
 
172 aa  44.3  0.0006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.345052  normal  0.266454 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1769  hypothetical protein  30.28 
 
 
292 aa  44.3  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.026632  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1900  hypothetical protein  35.4 
 
 
250 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1535  paREP11  38.37 
 
 
114 aa  41.2  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.92809 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>