12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1600 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1600  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  264  2.9999999999999995e-70  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0943  DNA polymerase beta subunit  65.15 
 
 
136 aa  180  7e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.31536  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0474  hypothetical protein  46.34 
 
 
134 aa  93.2  1e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.763339  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1093  hypothetical protein  35.38 
 
 
137 aa  58.5  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1533  hypothetical protein  40.17 
 
 
137 aa  58.2  0.00000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.959359  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0556  hypothetical protein  40.17 
 
 
137 aa  57.8  0.00000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0112545  hitchhiker  0.00000236573 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0323  hypothetical protein  40 
 
 
134 aa  57  0.00000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1678  DNA polymerase beta subunit  34.78 
 
 
153 aa  52  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000143849  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1769  hypothetical protein  33.04 
 
 
292 aa  46.6  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.026632  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  34.31 
 
 
271 aa  43.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1102  hypothetical protein  26.96 
 
 
139 aa  41.2  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.431617 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1668  DNA polymerase beta domain protein region  32.08 
 
 
146 aa  41.6  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>