16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1410 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1410  paREP11  100 
 
 		 172 aa  335  1.9999999999999998e-91  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.345052  normal  0.266454 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  39.64 
 
 		 271 aa  81.6  0.000000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1370  DNA polymerase beta subunit  33.77 
 
 		 241 aa  60.8  0.000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0334218 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1900  hypothetical protein  31.58 
 
 		 250 aa  52.4  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1668  DNA polymerase beta domain protein region  36.21 
 
 		 146 aa  51.6  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3253  DNA polymerase beta domain protein region  38.98 
 
 		 132 aa  49.3  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1535  paREP11  38.83 
 
 		 114 aa  47.8  0.00008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.92809 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1438  DNA polymerase beta subunit  32.11 
 
 		 129 aa  46.2  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000026658  hitchhiker  0.0000058254 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0474  hypothetical protein  40.82 
 
 		 134 aa  44.3  0.0008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.763339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1422  DNA polymerase beta subunit  36.61 
 
 		 123 aa  43.9  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.747879  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3015  DNA polymerase beta subunit  39.73 
 
 		 142 aa  44.3  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.914629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1277  DNA polymerase beta subunit  35.64 
 
 		 145 aa  43.1  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.288341  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1082  hypothetical protein  30.39 
 
 		 256 aa  42  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.167925  normal  0.321857 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1105  DNA polymerase beta subunit  40.91 
 
 		 162 aa  42  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00137564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0250  DNA polymerase beta subunit  43.59 
 
 		 137 aa  41.2  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2244  DNA polymerase beta subunit  30.61 
 
 		 146 aa  41.2  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.521292  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>