22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1277 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1277  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 145 aa  286  7e-77  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.288341  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1025  DNA polymerase beta subunit  42.86 
 
 		 123 aa  74.3  0.0000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.278001  normal  0.373877 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1692  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000104871  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1668  DNA polymerase beta domain protein region  36.19 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1438  DNA polymerase beta subunit  32.29 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000026658  hitchhiker  0.0000058254 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1672  DNA polymerase beta domain protein region  27.97 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1900  hypothetical protein  46.48 
 
 		 250 aa  47.8  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  30.77 
 
 		 271 aa  47.4  0.00007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0320  DNA polymerase beta subunit  33.63 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1252  DNA polymerase beta subunit  34.62 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1589  DNA polymerase beta domain protein region  28.23 
 
 		 132 aa  44.7  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.382693  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1410  paREP11  35.24 
 
 		 172 aa  44.7  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.345052  normal  0.266454 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1999  DNA polymerase beta domain protein region  28.78 
 
 		 155 aa  43.9  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.95495  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1471  DNA polymerase beta domain protein region  31.25 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.764189  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1535  paREP11  37.5 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.92809 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1422  DNA polymerase beta subunit  34.15 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.747879  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3749  hypothetical protein  32.14 
 
 		 135 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2422  DNA polymerase beta subunit  27.41 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0766  DNA polymerase beta subunit  31 
 
 		 139 aa  41.2  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2567  DNA polymerase beta domain protein region  26.73 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0185  DNA polymerase, beta-like region  28.18 
 
 		 150 aa  40.4  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.519951 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1694  DNA polymerase beta subunit  31.76 
 
 		 97 aa  40.4  0.009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.366424  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>