21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1252 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1252  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 147 aa  284  2e-76  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0320  DNA polymerase beta subunit  41.96 
 
 		 134 aa  83.2  0.000000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0766  DNA polymerase beta subunit  39.29 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1438  DNA polymerase beta subunit  37.27 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000026658  hitchhiker  0.0000058254 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1589  DNA polymerase beta domain protein region  33.96 
 
 		 132 aa  50.8  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.382693  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1692  DNA polymerase beta subunit  48.68 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000104871  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1999  DNA polymerase beta domain protein region  40 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.95495  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1471  DNA polymerase beta domain protein region  33.65 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.764189  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3015  DNA polymerase beta subunit  39.47 
 
 		 142 aa  47.4  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.914629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1182  hypothetical protein  25.93 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.422809  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1277  DNA polymerase beta subunit  34.62 
 
 		 145 aa  46.2  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.288341  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1588  hypothetical protein  30.59 
 
 		 146 aa  45.4  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0244  DNA polymerase beta domain protein region  31.52 
 
 		 131 aa  44.7  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0331  hypothetical protein  32.29 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0231643  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1816  hypothetical protein  34.94 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000972669  normal  0.858588 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1972  DNA polymerase beta domain protein region  28.21 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.18731 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0209  hypothetical protein  33 
 
 		 142 aa  42  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.184699  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1535  paREP11  34.67 
 
 		 114 aa  42  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.92809 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0185  DNA polymerase, beta-like region  27.18 
 
 		 150 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.519951 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1668  DNA polymerase beta domain protein region  29.41 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4528  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 152 aa  40.8  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.373361  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>