14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0320 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0320  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 
134 aa  266  5.9999999999999995e-71  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1252  DNA polymerase beta subunit  41.96 
 
 
147 aa  83.2  0.000000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1438  DNA polymerase beta subunit  39.5 
 
 
129 aa  82.8  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000026658  hitchhiker  0.0000058254 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0185  DNA polymerase, beta-like region  33.02 
 
 
150 aa  74.3  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.519951 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1182  hypothetical protein  33.33 
 
 
143 aa  58.9  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.422809  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1588  hypothetical protein  27.42 
 
 
146 aa  58.9  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1692  DNA polymerase beta subunit  33.87 
 
 
139 aa  57.8  0.00000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000104871  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0172  nucleotidyltransferase  34.02 
 
 
109 aa  52.8  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.778206  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2352  DNA polymerase, beta-like region  36.46 
 
 
148 aa  51.6  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00951181  normal  0.0970434 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1668  DNA polymerase beta domain protein region  25 
 
 
146 aa  47.4  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1277  DNA polymerase beta subunit  33.63 
 
 
145 aa  47.4  0.00008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.288341  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0209  hypothetical protein  27.72 
 
 
142 aa  47  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.184699  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0250  DNA polymerase beta subunit  35.96 
 
 
137 aa  44.7  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1672  DNA polymerase beta domain protein region  27.45 
 
 
146 aa  41.6  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>