34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1588 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1588  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  290  5e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0209  hypothetical protein  42.42 
 
 		 142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.184699  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0185  DNA polymerase, beta-like region  31.97 
 
 		 150 aa  80.5  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.519951 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  34.51 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2244  DNA polymerase beta subunit  28.78 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.521292  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0320  DNA polymerase beta subunit  27.42 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1678  DNA polymerase beta subunit  36.45 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000143849  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0172  nucleotidyltransferase  32.67 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.778206  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2352  DNA polymerase, beta-like region  29.92 
 
 		 148 aa  52.8  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00951181  normal  0.0970434 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2195  DNA polymerase beta domain protein region  32.04 
 
 		 145 aa  52.8  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000295232  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0074  DNA polymerase beta subunit  27.56 
 
 		 167 aa  52  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.649799  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1668  DNA polymerase beta domain protein region  25.83 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4528  DNA polymerase beta subunit  30.53 
 
 		 152 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.373361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0882  DNA polymerase beta subunit  32.65 
 
 		 156 aa  50.8  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0545  DNA polymerase beta domain protein region  34.45 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00116753  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1182  hypothetical protein  28.28 
 
 		 143 aa  48.1  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.422809  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0250  DNA polymerase beta subunit  30.4 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1999  DNA polymerase beta domain protein region  24.82 
 
 		 155 aa  47.8  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.95495  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0364  DNA polymerase beta subunit  27.34 
 
 		 148 aa  47.4  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0769  DNA polymerase beta subunit  26.05 
 
 		 140 aa  47.4  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0178  DNA polymerase, beta-like region  32.08 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0107452  normal  0.933077 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2422  DNA polymerase beta subunit  36.11 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1252  DNA polymerase beta subunit  30.59 
 
 		 147 aa  45.4  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1672  DNA polymerase beta domain protein region  23.01 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1760  DNA polymerase beta domain protein region  33 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3015  DNA polymerase beta subunit  27.41 
 
 		 142 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.914629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2567  DNA polymerase beta domain protein region  26.05 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1861  DNA polymerase beta subunit  31.03 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1692  DNA polymerase beta subunit  24.24 
 
 		 139 aa  41.2  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000104871  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0428  DNA polymerase, beta-like region  27.62 
 
 		 153 aa  41.6  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0480568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2946  DNA polymerase beta subunit  30 
 
 		 131 aa  40.8  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3257  DNA polymerase, beta-like region  32 
 
 		 132 aa  40.8  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00329127  hitchhiker  2.42256e-16 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1105  DNA polymerase beta subunit  43.48 
 
 		 162 aa  40.4  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00137564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0133  DNA polymerase beta subunit  29.57 
 
 		 131 aa  40.4  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>