68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0882 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0882  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 156 aa  305  1.0000000000000001e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3257  DNA polymerase, beta-like region  45.74 
 
 		 132 aa  95.1  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00329127  hitchhiker  2.42256e-16 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0658  DNA polymerase beta subunit  39.2 
 
 		 137 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311195  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0364  DNA polymerase beta subunit  35 
 
 		 148 aa  70.5  0.000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2244  DNA polymerase beta subunit  29.6 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.521292  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2352  DNA polymerase, beta-like region  31.82 
 
 		 148 aa  67.4  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00951181  normal  0.0970434 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  32.56 
 
 		 271 aa  67  0.00000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2563  DNA polymerase beta domain protein region  30.39 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2558  DNA polymerase beta domain protein region  30.39 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1678  DNA polymerase beta subunit  32.62 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000143849  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2978  DNA polymerase beta domain protein region  34.97 
 
 		 217 aa  62  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0074  DNA polymerase beta subunit  36.22 
 
 		 167 aa  62  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.649799  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2567  DNA polymerase beta domain protein region  31.86 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1999  DNA polymerase beta domain protein region  32.86 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.95495  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2195  DNA polymerase beta domain protein region  32.41 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000295232  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0250  DNA polymerase beta subunit  36 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4418  DNA polymerase beta subunit  31.82 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234666 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0769  DNA polymerase beta subunit  35.83 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0763  DNA polymerase beta subunit  30.77 
 
 		 143 aa  57  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.122769 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4000  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2954  DNA polymerase beta subunit  33.9 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1252  DNA polymerase beta domain protein region  35.29 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.859255 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0178  DNA polymerase, beta-like region  38.38 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0107452  normal  0.933077 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1668  DNA polymerase beta domain protein region  31 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4528  DNA polymerase beta subunit  29.1 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.373361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1792  hypothetical protein  30.63 
 
 		 295 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210053 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0428  DNA polymerase, beta-like region  29.6 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0480568  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1672  DNA polymerase beta domain protein region  32.32 
 
 		 146 aa  52.4  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3654  hypothetical protein  34.43 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.544333  normal  0.731043 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2281  nucleotidyltransferase  30.51 
 
 		 132 aa  50.8  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0106509  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1105  DNA polymerase beta subunit  35.45 
 
 		 162 aa  50.4  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00137564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1588  hypothetical protein  32.65 
 
 		 146 aa  50.8  0.000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1861  DNA polymerase beta subunit  29.71 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1762  hypothetical protein  29.91 
 
 		 276 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.254099  normal  0.270022 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1316  nucleotidyltransferase  30 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2422  DNA polymerase beta subunit  28.57 
 
 		 135 aa  47.8  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0209  hypothetical protein  31.93 
 
 		 142 aa  47.4  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.184699  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0825  DNA polymerase beta subunit  31.07 
 
 		 140 aa  47.4  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.453012  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2332  DNA polymerase beta subunit  34.83 
 
 		 128 aa  47.4  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1422  DNA polymerase beta subunit  37.21 
 
 		 123 aa  47.4  0.00007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.747879  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2734  DNA polymerase beta domain protein region  34.45 
 
 		 144 aa  47.4  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.174135  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1370  DNA polymerase beta subunit  30.28 
 
 		 241 aa  47  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0334218 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1075  DNA polymerase beta subunit  33.73 
 
 		 132 aa  47  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141135 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0545  DNA polymerase beta domain protein region  27.27 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00116753  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0244  DNA polymerase beta domain protein region  29.17 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0269  nucleotidyltransferase  24.22 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0551  DNA polymerase beta domain protein region  36.11 
 
 		 106 aa  45.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1440  hypothetical protein  29.79 
 
 		 252 aa  45.1  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3015  DNA polymerase beta subunit  29.46 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.914629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0185  DNA polymerase, beta-like region  29.37 
 
 		 150 aa  44.3  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.519951 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0760  DNA polymerase beta subunit  26.53 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0261005  normal  0.995846 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1397  DNA polymerase beta domain protein region  29.67 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0347326  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5679  putative nucleotidyltransferase  23.44 
 
 		 135 aa  43.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0666104  decreased coverage  0.000482275 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3044  hypothetical protein  25.77 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.137112  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4099  hypothetical protein  32.43 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.41555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0295  DNA polymerase beta domain protein region  26.88 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0758  DNA polymerase beta subunit  26.6 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.258998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0372  DNA polymerase beta subunit  30.85 
 
 		 141 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000034054  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0893  DNA polymerase beta domain-containing protein region  31.03 
 
 		 143 aa  42  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1563  DNA polymerase beta domain protein region  28.7 
 
 		 152 aa  42.4  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2165  DNA polymerase beta subunit  22.73 
 
 		 151 aa  42  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0766  DNA polymerase, beta-like region  27.64 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.576445  normal  0.367206 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0284  DNA polymerase beta domain protein region  26.67 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0703  DNA polymerase beta domain protein region  27.27 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000025763  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1772  DNA polymerase beta domain protein region  34.21 
 
 		 99 aa  40.8  0.008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1972  DNA polymerase beta domain protein region  28.92 
 
 		 131 aa  40.8  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.18731 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1883  DNA polymerase, beta-like region  29.89 
 
 		 108 aa  40.4  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3203  DNA polymerase beta subunit  35 
 
 		 98 aa  40.4  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>