52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1422 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1422  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 123 aa  244  3e-64  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.747879  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1370  DNA polymerase beta subunit  67.54 
 
 		 241 aa  155  2e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0334218 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  40 
 
 		 271 aa  73.9  0.0000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0250  DNA polymerase beta subunit  34.4 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1900  hypothetical protein  40 
 
 		 250 aa  57.8  0.00000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0178  DNA polymerase, beta-like region  36.27 
 
 		 163 aa  57.4  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0107452  normal  0.933077 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0658  DNA polymerase beta subunit  40.82 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311195  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4528  DNA polymerase beta subunit  30.51 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.373361  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1668  DNA polymerase beta domain protein region  32.52 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2352  DNA polymerase, beta-like region  36.36 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00951181  normal  0.0970434 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2195  DNA polymerase beta domain protein region  35.54 
 
 		 145 aa  52.8  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000295232  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1535  paREP11  39.13 
 
 		 114 aa  53.1  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.92809 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1972  DNA polymerase beta domain protein region  31.13 
 
 		 131 aa  51.6  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.18731 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0225  DNA polymerase beta domain protein region  33.01 
 
 		 142 aa  51.2  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3257  DNA polymerase, beta-like region  37.27 
 
 		 132 aa  50.8  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00329127  hitchhiker  2.42256e-16 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1762  hypothetical protein  30.47 
 
 		 276 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.254099  normal  0.270022 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1792  hypothetical protein  31.25 
 
 		 295 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210053 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0074  DNA polymerase beta subunit  32.08 
 
 		 167 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.649799  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1440  hypothetical protein  32.79 
 
 		 252 aa  48.1  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1999  DNA polymerase beta domain protein region  33.05 
 
 		 155 aa  48.1  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.95495  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0769  DNA polymerase beta subunit  32.71 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0882  DNA polymerase beta subunit  37.21 
 
 		 156 aa  47.4  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1672  DNA polymerase beta domain protein region  31.73 
 
 		 146 aa  47.4  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1816  hypothetical protein  33.73 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000972669  normal  0.858588 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3618  DNA polymerase beta domain protein region  30.21 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1105  DNA polymerase beta subunit  32.67 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00137564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3015  DNA polymerase beta subunit  30.25 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.914629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1082  hypothetical protein  43.48 
 
 		 256 aa  45.1  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.167925  normal  0.321857 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2244  DNA polymerase beta subunit  27.62 
 
 		 146 aa  45.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.521292  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1102  hypothetical protein  35.48 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.836571  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0357  DNA polymerase beta subunit  32.65 
 
 		 101 aa  44.3  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0316504 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1410  paREP11  36.61 
 
 		 172 aa  43.9  0.0008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.345052  normal  0.266454 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2573  DNA polymerase beta domain protein region  38.89 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0668582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0331  hypothetical protein  35.44 
 
 		 134 aa  43.5  0.0009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0231643  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0444  nucleotidyltransferase  34.78 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.190147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3253  DNA polymerase beta domain protein region  27.78 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50230  DNA polymerase, beta-like region-containing protein  33.71 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1769  hypothetical protein  30.19 
 
 		 292 aa  43.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.026632  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1277  DNA polymerase beta subunit  34.45 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.288341  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0758  DNA polymerase beta subunit  28.57 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.258998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1164  DNA polymerase beta subunit  34.29 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1589  DNA polymerase beta domain protein region  30 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.382693  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0545  DNA polymerase beta domain protein region  27.52 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00116753  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0172  nucleotidyltransferase  31.07 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.778206  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0943  DNA polymerase beta subunit  35.87 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.31536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3654  hypothetical protein  32.71 
 
 		 137 aa  40.8  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.544333  normal  0.731043 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0185  DNA polymerase, beta-like region  31.13 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.519951 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2954  DNA polymerase beta subunit  30 
 
 		 133 aa  40.4  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1038  DNA polymerase beta subunit  40.79 
 
 		 118 aa  40  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0191145  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3436  DNA polymerase beta subunit  35.96 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0053  DNA polymerase beta subunit  31.25 
 
 		 102 aa  40  0.01  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0582464  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1381  DNA polymerase beta domain protein region  32.43 
 
 		 97 aa  40  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>