13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1535 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_1535  paREP11  100 
 
 		 114 aa  224  2e-58  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.92809 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1082  hypothetical protein  69.64 
 
 		 256 aa  143  9e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.167925  normal  0.321857 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1900  hypothetical protein  49.54 
 
 		 250 aa  99  2e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1422  DNA polymerase beta subunit  39.13 
 
 		 123 aa  53.1  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.747879  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1410  paREP11  38.83 
 
 		 172 aa  47.8  0.00006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.345052  normal  0.266454 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0323  hypothetical protein  38.16 
 
 		 134 aa  46.2  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1370  DNA polymerase beta subunit  35.23 
 
 		 241 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0334218 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1252  DNA polymerase beta subunit  34.67 
 
 		 147 aa  42  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1277  DNA polymerase beta subunit  37.5 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.288341  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0474  hypothetical protein  38.37 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.763339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1093  hypothetical protein  45.45 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0556  hypothetical protein  32.08 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0112545  hitchhiker  0.00000236573 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3749  hypothetical protein  36.78 
 
 		 135 aa  40  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>