21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1900 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1900  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  491  9.999999999999999e-139  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1082  hypothetical protein  48.78 
 
 		 256 aa  195  5.000000000000001e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.167925  normal  0.321857 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1535  paREP11  49.54 
 
 		 114 aa  99  7e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.92809 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1370  DNA polymerase beta subunit  36.79 
 
 		 241 aa  93.2  3e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0334218 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1534  hypothetical protein  43.56 
 
 		 101 aa  83.2  0.000000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  30.89 
 
 		 271 aa  66.2  0.0000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1422  DNA polymerase beta subunit  40 
 
 		 123 aa  57.8  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.747879  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1410  paREP11  31.58 
 
 		 172 aa  52.4  0.000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.345052  normal  0.266454 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0250  DNA polymerase beta subunit  37.39 
 
 		 137 aa  51.6  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0829  DNA polymerase beta subunit  35.29 
 
 		 98 aa  50.8  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.141069  normal  0.412533 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0323  hypothetical protein  37.5 
 
 		 134 aa  47.8  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1277  DNA polymerase beta subunit  46.48 
 
 		 145 aa  47.4  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.288341  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1093  hypothetical protein  37.8 
 
 		 137 aa  46.6  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1438  DNA polymerase beta subunit  36.78 
 
 		 129 aa  46.6  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000026658  hitchhiker  0.0000058254 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1113  DNA polymerase beta subunit  34.52 
 
 		 109 aa  45.8  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0331  hypothetical protein  33.04 
 
 		 134 aa  43.9  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0231643  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1668  DNA polymerase beta domain protein region  31.97 
 
 		 146 aa  44.3  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1164  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 113 aa  43.1  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0760  DNA polymerase beta subunit  32 
 
 		 133 aa  43.1  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0261005  normal  0.995846 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0474  hypothetical protein  35.4 
 
 		 134 aa  42.7  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.763339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0769  DNA polymerase beta subunit  32.5 
 
 		 140 aa  42.7  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452444 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>