18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0760 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0760  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 133 aa  270  3e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0261005  normal  0.995846 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3044  hypothetical protein  45.6 
 
 		 129 aa  114  3.9999999999999997e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.137112  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1792  hypothetical protein  45.69 
 
 		 295 aa  99  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210053 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1762  hypothetical protein  46.36 
 
 		 276 aa  98.2  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.254099  normal  0.270022 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0758  DNA polymerase beta subunit  38.93 
 
 		 136 aa  92.8  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.258998  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1440  hypothetical protein  47 
 
 		 252 aa  89  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2352  DNA polymerase, beta-like region  24.41 
 
 		 148 aa  51.2  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00951181  normal  0.0970434 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1105  DNA polymerase beta subunit  35.42 
 
 		 162 aa  50.4  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00137564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4000  DNA polymerase beta domain protein region  24.17 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0074  DNA polymerase beta subunit  24.06 
 
 		 167 aa  47  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.649799  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0882  DNA polymerase beta subunit  26.53 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1900  hypothetical protein  32 
 
 		 250 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0225  DNA polymerase beta domain protein region  29.77 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2195  DNA polymerase beta domain protein region  25.51 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000295232  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1678  DNA polymerase beta subunit  29.81 
 
 		 153 aa  41.6  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000143849  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3654  hypothetical protein  28.44 
 
 		 137 aa  40.8  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.544333  normal  0.731043 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0545  DNA polymerase beta domain protein region  22.12 
 
 		 135 aa  40.4  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00116753  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  26.73 
 
 		 271 aa  40.4  0.009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>