25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I3044 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I3044  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  267  4e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.137112  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0760  DNA polymerase beta subunit  45.6 
 
 		 133 aa  114  3.9999999999999997e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0261005  normal  0.995846 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0758  DNA polymerase beta subunit  42.48 
 
 		 136 aa  93.2  9e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.258998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1762  hypothetical protein  42.34 
 
 		 276 aa  86.7  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.254099  normal  0.270022 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1792  hypothetical protein  40.71 
 
 		 295 aa  85.1  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210053 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1440  hypothetical protein  45 
 
 		 252 aa  84.3  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1105  DNA polymerase beta subunit  36.46 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00137564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2352  DNA polymerase, beta-like region  28.97 
 
 		 148 aa  47.4  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00951181  normal  0.0970434 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0074  DNA polymerase beta subunit  35.23 
 
 		 167 aa  47.4  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.649799  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0769  DNA polymerase beta subunit  30 
 
 		 140 aa  47.4  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4484  DNA polymerase beta domain protein region  30.85 
 
 		 146 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0766  DNA polymerase beta subunit  32.35 
 
 		 139 aa  45.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2195  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 145 aa  44.7  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000295232  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3165  hypothetical protein  28.81 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2954  DNA polymerase beta subunit  28.46 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1471  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.764189  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0806  nucleotidyltransferase substrate binding protein, HI0074 family  29.79 
 
 		 247 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0882  DNA polymerase beta subunit  25.77 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2422  DNA polymerase beta subunit  27.64 
 
 		 135 aa  42  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0545  DNA polymerase beta domain protein region  27.91 
 
 		 135 aa  42  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00116753  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1680  DNA polymerase, beta-like region  31.88 
 
 		 281 aa  41.6  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3303  DNA polymerase beta domain protein region  53.12 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.433068 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1370  DNA polymerase beta subunit  28.44 
 
 		 241 aa  40.4  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0334218 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0178  DNA polymerase, beta-like region  28.74 
 
 		 163 aa  40.8  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0107452  normal  0.933077 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3257  DNA polymerase, beta-like region  23.26 
 
 		 132 aa  40.4  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00329127  hitchhiker  2.42256e-16 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>