89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0806 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0806  nucleotidyltransferase substrate binding protein, HI0074 family  100 
 
 
247 aa  507  1e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2574  nucleotidyltransferase substrate binding protein, HI0074 family  48.51 
 
 
133 aa  138  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0898104  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1136  nucleotidyltransferase substrate binding protein, HI0074 family  46.46 
 
 
127 aa  124  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0050  HI0074 family nucleotidyltransferase substrate binding protein  50.45 
 
 
133 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0191135  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0764  nucleotidyltransferase substrate binding protein, HI0074 family  41.22 
 
 
133 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.537775  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2654  HI0074 family nucleotidyltransferase substrate binding protein  47.29 
 
 
151 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.888693  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0348  nucleotidyltransferase substrate binding protein, HI0074 family  41.54 
 
 
132 aa  112  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.46412  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1773  nucleotidyltransferase substrate binding protein, HI0074 family  51.89 
 
 
129 aa  107  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1208  HI0074 family nucleotidyltransferase substrate binding protein  42.75 
 
 
140 aa  102  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1039  HI0074 family nucleotidyltransferase substrate binding protein  43.85 
 
 
135 aa  100  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00506895  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4506  HI0074 family nucleotidyltransferase substrate binding protein  57.65 
 
 
146 aa  99  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0839555 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0753  nucleotidyltransferase substrate binding protein, HI0074 family  42.64 
 
 
134 aa  97.1  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0291  HI0074 family nucleotidyltransferase substrate binding protein  40 
 
 
149 aa  96.3  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2905  nucleotidyltransferase substrate-binding protein  41.54 
 
 
139 aa  96.3  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2847  hypothetical protein  41.41 
 
 
139 aa  95.9  5e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1134  HI0074 family nucleotidyltransferase substrate binding protein  39.23 
 
 
139 aa  94.7  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0768  nucleotidyltransferase substrate binding protein, HI0074 family  41.86 
 
 
134 aa  94.4  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1673  nucleotidyltransferase substrate binding protein  39.06 
 
 
134 aa  93.6  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.659864  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0232  nucleotidyltransferase substrate binding protein, HI0074 family  37.8 
 
 
141 aa  93.6  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1655  nucleotidyltransferase substrate binding protein, HI0074 family  39.55 
 
 
140 aa  92  8e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.834334  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0271  hypothetical protein  41.27 
 
 
139 aa  90.9  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.20168  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0898  hypothetical protein  38.1 
 
 
136 aa  90.9  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0094  HI0074 family nucleotidyltransferase substrate binding protein  40.83 
 
 
137 aa  89.7  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.257983 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1476  nucleotidyltransferase substrate binding protein, HI0074 family  37.5 
 
 
140 aa  88.2  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2681  nucleotidyltransferase substrate binding protein, HI0074 family  40 
 
 
136 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.485483  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02500  Nucleotidyltransferase substrate binding protein, HI0074  51.81 
 
 
142 aa  84  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.582316  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0490  nucleotidyltransferase substrate binding protein  39.32 
 
 
138 aa  83.2  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.26398  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1937  hypothetical protein  35.83 
 
 
133 aa  81.3  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0763  DNA polymerase beta domain protein region  39.8 
 
 
111 aa  80.5  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.667533  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1690  nucleotidyltransferase substrate binding protein, HI0074 family  34.4 
 
 
135 aa  80.1  0.00000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0359217 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1350  nucleotidyltransferase substrate binding protein, HI0074 family  35.2 
 
 
139 aa  79  0.00000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0068  nucleotidyltransferase substrate binding protein, HI0074 family  38.1 
 
 
199 aa  78.6  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0624  HI0074 family nucleotidyltransferase substrate binding protein  30.89 
 
 
130 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1590  nucleotidyltransferase substrate binding protein, HI0074 family  34.33 
 
 
135 aa  78.2  0.0000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2573  DNA polymerase beta domain protein region  38.14 
 
 
97 aa  75.5  0.0000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0668582  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0295  DNA polymerase beta domain protein region  39.8 
 
 
98 aa  72.8  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1569  nucleotidyltransferase substrate binding protein, HI0074 family  36.27 
 
 
124 aa  72.4  0.000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0284  DNA polymerase beta domain protein region  39.39 
 
 
99 aa  72  0.000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0220  nucleotidyltransferase substrate-binding protein, putative  39.82 
 
 
140 aa  72  0.000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0593  nucleotidyltransferase substrate-binding protein  35.25 
 
 
136 aa  69.3  0.00000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0051  DNA polymerase beta subunit  39.78 
 
 
97 aa  67  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0498801  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1038  DNA polymerase beta subunit  38.54 
 
 
118 aa  65.1  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0191145  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2536  nucleotidyltransferase substrate-binding protein  31.62 
 
 
138 aa  63.9  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00079468  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3593  nucleotidyltransferase substrate binding protein, HI0074 family  36.04 
 
 
133 aa  63.5  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00156598  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5240  DNA polymerase beta domain protein region  35.92 
 
 
104 aa  62.8  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1380  nucleotidyltransferase substrate binding protein, HI0074 family  27.5 
 
 
152 aa  62.8  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2026  nucleotidyltransferase substrate binding protein, HI0074 family  27.43 
 
 
150 aa  60.5  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0157738  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1560  DNA polymerase beta domain protein region  35.58 
 
 
105 aa  59.7  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1475  DNA polymerase beta domain protein region  34.69 
 
 
100 aa  59.7  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1349  DNA polymerase beta domain protein region  38.95 
 
 
96 aa  59.3  0.00000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1381  DNA polymerase beta domain protein region  38.78 
 
 
97 aa  58.5  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1674  DNA polymerase, beta-like region  35.11 
 
 
105 aa  58.5  0.00000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.538651  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1133  DNA polymerase beta subunit  40 
 
 
123 aa  57.4  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0292  DNA polymerase beta subunit  33.02 
 
 
108 aa  56.6  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0233  DNA polymerase beta domain protein region  34.29 
 
 
108 aa  56.2  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02490  nucleotidyltransferase  34.74 
 
 
103 aa  56.2  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.456196  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1734  nucleotidyltransferase substrate binding protein, HI0074 family  30 
 
 
140 aa  55.1  0.0000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0347  DNA polymerase beta domain protein region  34.95 
 
 
102 aa  55.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0270  nucleotidyltransferase domain-containing protein  31.25 
 
 
135 aa  54.3  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.440685  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0897  HsdR-like, putative type I restriction deoxyribonuclease  33.67 
 
 
1294 aa  53.9  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3352  HI0074 family nucleotidyltransferase substrate binding protein  37.11 
 
 
137 aa  54.3  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0069  DNA polymerase beta domain protein region  31.82 
 
 
108 aa  54.3  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1570  DNA polymerase beta domain protein region  40.85 
 
 
102 aa  53.1  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4507  DNA polymerase beta subunit  32.29 
 
 
103 aa  52.8  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.152779 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0754  DNA polymerase beta domain protein region  33.68 
 
 
106 aa  52.8  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.923157  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0769  DNA polymerase beta domain protein region  33.68 
 
 
106 aa  52  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3007  HI0074 family nucleotidyltransferase substrate binding protein  33.64 
 
 
139 aa  52  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2848  hypothetical protein  34.31 
 
 
108 aa  51.6  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0130  nucleotidyltransferase substrate binding protein, HI0074 family  27.97 
 
 
141 aa  51.6  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3506  HI0074 family nucleotidyltransferase substrate binding protein  34.02 
 
 
141 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0269  nucleotidyltransferase substrate binding protein, HI0074 family  31.76 
 
 
147 aa  51.2  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3009  HI0074 family nucleotidyltransferase substrate binding protein  31.34 
 
 
137 aa  50.8  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.549001  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2025  DNA polymerase beta domain protein region  44 
 
 
82 aa  50.1  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0505934  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2655  DNA polymerase beta subunit  30.48 
 
 
108 aa  50.1  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.748854  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1207  DNA polymerase beta subunit  32.04 
 
 
105 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.901472  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0491  hypothetical protein  31.58 
 
 
112 aa  49.3  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.484621  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1691  DNA polymerase beta domain protein region  39.47 
 
 
95 aa  49.3  0.00006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0339005 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0268  DNA polymerase beta domain protein region  34.02 
 
 
100 aa  48.9  0.00007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0417  DNA polymerase beta domain protein region  34.74 
 
 
109 aa  48.1  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0095  DNA polymerase beta subunit  31.31 
 
 
112 aa  47  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.365343 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4036  HI0074 family nucleotidyltransferase substrate binding protein  39.44 
 
 
149 aa  47  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0594  hypothetical protein  33 
 
 
102 aa  46.2  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1936  putative nucleotidyltransferase  35.53 
 
 
107 aa  45.4  0.0009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1772  DNA polymerase beta domain protein region  36.71 
 
 
99 aa  44.7  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3654  hypothetical protein  30.56 
 
 
137 aa  44.3  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.544333  normal  0.731043 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3015  DNA polymerase beta subunit  36.25 
 
 
142 aa  42.7  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.914629  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3044  hypothetical protein  29.79 
 
 
129 aa  42.7  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.137112  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07020  hypothetical protein  29.32 
 
 
143 aa  42  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2646  nucleotidyltransferase substrate binding protein, HI0074 family  27.43 
 
 
141 aa  42  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00856355 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>