38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2655 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_2655  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 108 aa  225  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.748854  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2848  hypothetical protein  51.04 
 
 		 108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5240  DNA polymerase beta domain protein region  46.88 
 
 		 104 aa  107  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02490  nucleotidyltransferase  48.98 
 
 		 103 aa  106  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.456196  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1133  DNA polymerase beta subunit  47.47 
 
 		 123 aa  104  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1475  DNA polymerase beta domain protein region  43.75 
 
 		 100 aa  94.4  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0095  DNA polymerase beta subunit  38.14 
 
 		 112 aa  85.5  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.365343 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0897  HsdR-like, putative type I restriction deoxyribonuclease  37.61 
 
 		 1294 aa  84.7  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0069  DNA polymerase beta domain protein region  37.11 
 
 		 108 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0594  hypothetical protein  37.5 
 
 		 102 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0233  DNA polymerase beta domain protein region  37.11 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0292  DNA polymerase beta subunit  36.08 
 
 		 108 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0491  hypothetical protein  33.33 
 
 		 112 aa  73.2  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.484621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1674  DNA polymerase, beta-like region  35.79 
 
 		 105 aa  71.6  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.538651  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1207  DNA polymerase beta subunit  34.02 
 
 		 105 aa  65.5  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.901472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2573  DNA polymerase beta domain protein region  26.32 
 
 		 97 aa  61.2  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0668582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1038  DNA polymerase beta subunit  25.26 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0191145  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0769  DNA polymerase beta domain protein region  35.9 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0051  DNA polymerase beta subunit  29.47 
 
 		 97 aa  57.4  0.00000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0498801  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0295  DNA polymerase beta domain protein region  34.02 
 
 		 98 aa  57  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0284  DNA polymerase beta domain protein region  34.02 
 
 		 99 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0754  DNA polymerase beta domain protein region  34.62 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.923157  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1656  DNA polymerase beta domain protein region  39.58 
 
 		 103 aa  55.1  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0763  DNA polymerase beta domain protein region  26.04 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.667533  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1560  DNA polymerase beta domain protein region  32.29 
 
 		 105 aa  54.3  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4507  DNA polymerase beta subunit  31.4 
 
 		 103 aa  53.9  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.152779 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1691  DNA polymerase beta domain protein region  30.95 
 
 		 95 aa  52.4  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0339005 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1381  DNA polymerase beta domain protein region  32.29 
 
 		 97 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0806  nucleotidyltransferase substrate binding protein, HI0074 family  30.48 
 
 		 247 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0347  DNA polymerase beta domain protein region  28.72 
 
 		 102 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1349  DNA polymerase beta domain protein region  30.53 
 
 		 96 aa  47  0.00009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2025  DNA polymerase beta domain protein region  31.51 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0505934  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4370  DNA polymerase beta domain protein region  27.27 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0268  DNA polymerase beta domain protein region  29.9 
 
 		 100 aa  42  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  34.33 
 
 		 271 aa  41.2  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0270  nucleotidyltransferase domain-containing protein  24.3 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.440685  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4035  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 103 aa  40.8  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0872  DNA polymerase beta subunit  30.93 
 
 		 104 aa  40  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.178171  hitchhiker  0.0000000998415 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>