46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0095 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0095  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 112 aa  227  3e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.365343 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1207  DNA polymerase beta subunit  58.25 
 
 		 105 aa  127  6e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.901472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0069  DNA polymerase beta domain protein region  61.39 
 
 		 108 aa  122  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0233  DNA polymerase beta domain protein region  54.29 
 
 		 108 aa  122  2e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1133  DNA polymerase beta subunit  56.48 
 
 		 123 aa  120  7e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1475  DNA polymerase beta domain protein region  58.59 
 
 		 100 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0292  DNA polymerase beta subunit  52.38 
 
 		 108 aa  114  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5240  DNA polymerase beta domain protein region  51.52 
 
 		 104 aa  102  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02490  nucleotidyltransferase  50 
 
 		 103 aa  97.4  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.456196  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2848  hypothetical protein  44 
 
 		 108 aa  92  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0897  HsdR-like, putative type I restriction deoxyribonuclease  45.36 
 
 		 1294 aa  91.7  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1674  DNA polymerase, beta-like region  45.83 
 
 		 105 aa  86.3  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.538651  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0491  hypothetical protein  42.86 
 
 		 112 aa  85.9  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.484621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2655  DNA polymerase beta subunit  38.14 
 
 		 108 aa  85.5  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.748854  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1656  DNA polymerase beta domain protein region  56.44 
 
 		 103 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0754  DNA polymerase beta domain protein region  35.92 
 
 		 106 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.923157  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0769  DNA polymerase beta domain protein region  35.92 
 
 		 106 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0594  hypothetical protein  33.33 
 
 		 102 aa  67.8  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1691  DNA polymerase beta domain protein region  38.2 
 
 		 95 aa  67.8  0.00000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0339005 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0763  DNA polymerase beta domain protein region  29.52 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.667533  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2573  DNA polymerase beta domain protein region  30.3 
 
 		 97 aa  59.3  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0668582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1038  DNA polymerase beta subunit  30.48 
 
 		 118 aa  57.8  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0191145  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1349  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0051  DNA polymerase beta subunit  42.11 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0498801  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1560  DNA polymerase beta domain protein region  31.96 
 
 		 105 aa  52  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0270  nucleotidyltransferase domain-containing protein  30 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.440685  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0295  DNA polymerase beta domain protein region  26.92 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1381  DNA polymerase beta domain protein region  28.71 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0284  DNA polymerase beta domain protein region  26.42 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0331  hypothetical protein  34.88 
 
 		 134 aa  47  0.00008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0231643  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0806  nucleotidyltransferase substrate binding protein, HI0074 family  31.31 
 
 		 247 aa  47  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1589  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 132 aa  46.2  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.382693  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0268  DNA polymerase beta domain protein region  35.62 
 
 		 100 aa  45.4  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2025  DNA polymerase beta domain protein region  32.89 
 
 		 82 aa  45.1  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0505934  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0347  DNA polymerase beta domain protein region  30.61 
 
 		 102 aa  43.9  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1466  hypothetical protein  40.62 
 
 		 64 aa  43.9  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0131  DNA polymerase beta domain protein region  41.18 
 
 		 112 aa  43.9  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0221  hypothetical protein  26.42 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1471  DNA polymerase beta domain protein region  35.16 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.764189  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3505  DNA polymerase beta subunit  27.4 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1772  DNA polymerase beta domain protein region  29.47 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3592  DNA polymerase beta domain protein region  38.78 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000372185  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1936  putative nucleotidyltransferase  35.42 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4507  DNA polymerase beta subunit  32.14 
 
 		 103 aa  40.8  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.152779 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0502  DNA polymerase beta domain protein region  35.56 
 
 		 124 aa  40.4  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1570  DNA polymerase beta domain protein region  31.82 
 
 		 102 aa  40.4  0.008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>