35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0594 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0594  hypothetical protein  100 
 
 		 102 aa  210  3.9999999999999995e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0069  DNA polymerase beta domain protein region  38 
 
 		 108 aa  82  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5240  DNA polymerase beta domain protein region  37.37 
 
 		 104 aa  81.6  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2655  DNA polymerase beta subunit  37.5 
 
 		 108 aa  78.6  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.748854  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1475  DNA polymerase beta domain protein region  34.69 
 
 		 100 aa  77  0.00000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0233  DNA polymerase beta domain protein region  35 
 
 		 108 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02490  nucleotidyltransferase  35.35 
 
 		 103 aa  73.6  0.0000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.456196  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2848  hypothetical protein  34.91 
 
 		 108 aa  73.2  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0292  DNA polymerase beta subunit  34 
 
 		 108 aa  72  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0897  HsdR-like, putative type I restriction deoxyribonuclease  38 
 
 		 1294 aa  71.2  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1133  DNA polymerase beta subunit  34.34 
 
 		 123 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0491  hypothetical protein  32.67 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.484621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0095  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.365343 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0769  DNA polymerase beta domain protein region  34.34 
 
 		 106 aa  60.5  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1207  DNA polymerase beta subunit  32 
 
 		 105 aa  60.5  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.901472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1691  DNA polymerase beta domain protein region  31.82 
 
 		 95 aa  59.7  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0339005 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1674  DNA polymerase, beta-like region  30.53 
 
 		 105 aa  58.9  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.538651  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0754  DNA polymerase beta domain protein region  34.34 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.923157  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2573  DNA polymerase beta domain protein region  28.42 
 
 		 97 aa  57.4  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0668582  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0270  nucleotidyltransferase domain-containing protein  27.72 
 
 		 135 aa  57  0.00000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.440685  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1560  DNA polymerase beta domain protein region  26.8 
 
 		 105 aa  52  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1656  DNA polymerase beta domain protein region  28.57 
 
 		 103 aa  52.4  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0221  hypothetical protein  35.14 
 
 		 112 aa  51.2  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0763  DNA polymerase beta domain protein region  32.61 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.667533  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0051  DNA polymerase beta subunit  31.18 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0498801  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0806  nucleotidyltransferase substrate binding protein, HI0074 family  33 
 
 		 247 aa  46.2  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4507  DNA polymerase beta subunit  26.97 
 
 		 103 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.152779 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1038  DNA polymerase beta subunit  24.74 
 
 		 118 aa  44.3  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0191145  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3505  DNA polymerase beta subunit  31.94 
 
 		 115 aa  44.7  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2935  DNA polymerase beta subunit  32.58 
 
 		 115 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07030  nucleotidyltransferase  30.68 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1381  DNA polymerase beta domain protein region  31.63 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1021  nucleotidyltransferase  31.87 
 
 		 99 aa  41.6  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.598559  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3353  DNA polymerase beta subunit  28.57 
 
 		 112 aa  40.4  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1735  DNA polymerase beta domain protein region  26.88 
 
 		 106 aa  40.4  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>