20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_1021 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009727  CBUD_1021  nucleotidyltransferase  100 
 
 
99 aa  195  2.0000000000000003e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.598559  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0918  putative nucleotidyltransferase  97.98 
 
 
99 aa  191  3e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3505  DNA polymerase beta subunit  46.24 
 
 
115 aa  94  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3353  DNA polymerase beta subunit  45.36 
 
 
112 aa  90.5  7e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3592  DNA polymerase beta domain protein region  45.74 
 
 
96 aa  88.6  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000372185  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1735  DNA polymerase beta domain protein region  42.86 
 
 
106 aa  85.9  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3010  restriction modification system DNA specificity subunit  45.83 
 
 
549 aa  83.6  9e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.340841  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0221  hypothetical protein  41.41 
 
 
112 aa  80.1  0.000000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0417  DNA polymerase beta domain protein region  37.37 
 
 
109 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2935  DNA polymerase beta subunit  40.4 
 
 
115 aa  70.1  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07030  nucleotidyltransferase  38.64 
 
 
114 aa  67.4  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0268  DNA polymerase beta domain protein region  39.53 
 
 
100 aa  65.9  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2086  DNA polymerase beta subunit  42.53 
 
 
111 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.166795  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4035  DNA polymerase beta subunit  35.29 
 
 
103 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0551  DNA polymerase beta domain protein region  30.68 
 
 
106 aa  50.1  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1038  DNA polymerase beta subunit  36.26 
 
 
118 aa  46.2  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0191145  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2535  DNA polymerase, beta-like region  27.27 
 
 
116 aa  45.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000686331  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1570  DNA polymerase beta domain protein region  38.89 
 
 
102 aa  44.7  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0594  hypothetical protein  31.87 
 
 
102 aa  41.6  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0270  nucleotidyltransferase domain-containing protein  33.67 
 
 
135 aa  42  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.440685  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>