30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1735 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1735  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 106 aa  218  3e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0221  hypothetical protein  51.96 
 
 		 112 aa  108  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3592  DNA polymerase beta domain protein region  55.43 
 
 		 96 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000372185  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3010  restriction modification system DNA specificity subunit  44.34 
 
 		 549 aa  92  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.340841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3353  DNA polymerase beta subunit  48.89 
 
 		 112 aa  87.8  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3505  DNA polymerase beta subunit  44.94 
 
 		 115 aa  86.3  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1021  nucleotidyltransferase  42.86 
 
 		 99 aa  85.9  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.598559  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0918  putative nucleotidyltransferase  41.84 
 
 		 99 aa  82.8  0.000000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2086  DNA polymerase beta subunit  45.83 
 
 		 111 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.166795  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0417  DNA polymerase beta domain protein region  41.41 
 
 		 109 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2935  DNA polymerase beta subunit  41.35 
 
 		 115 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0268  DNA polymerase beta domain protein region  27.78 
 
 		 100 aa  61.6  0.000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07030  nucleotidyltransferase  37.37 
 
 		 114 aa  61.2  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4035  DNA polymerase beta subunit  32.95 
 
 		 103 aa  60.5  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2535  DNA polymerase, beta-like region  35.62 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000686331  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1772  DNA polymerase beta domain protein region  32.14 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0893  DNA polymerase beta domain-containing protein region  33 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1223  DNA polymerase beta domain protein region  43.82 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0270  nucleotidyltransferase domain-containing protein  35.64 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.440685  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1570  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 102 aa  45.1  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1691  DNA polymerase beta domain protein region  46.43 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0339005 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1207  DNA polymerase beta subunit  30.23 
 
 		 105 aa  42.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.901472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0131  DNA polymerase beta domain protein region  32.18 
 
 		 112 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0551  DNA polymerase beta domain protein region  31.91 
 
 		 106 aa  41.2  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1075  DNA polymerase beta subunit  35.11 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141135 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0133  DNA polymerase beta subunit  38.37 
 
 		 131 aa  40.8  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1560  DNA polymerase beta domain protein region  40 
 
 		 105 aa  40.8  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0069  DNA polymerase beta domain protein region  31.58 
 
 		 108 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0594  hypothetical protein  26.88 
 
 		 102 aa  40.4  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  35.71 
 
 		 271 aa  40  0.01  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>