37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl2848 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006369  lpl2848  hypothetical protein  100 
 
 		 108 aa  221  3e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1133  DNA polymerase beta subunit  53.33 
 
 		 123 aa  117  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02490  nucleotidyltransferase  54.64 
 
 		 103 aa  113  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.456196  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5240  DNA polymerase beta domain protein region  50.51 
 
 		 104 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2655  DNA polymerase beta subunit  51.04 
 
 		 108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.748854  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0233  DNA polymerase beta domain protein region  55.56 
 
 		 108 aa  106  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1475  DNA polymerase beta domain protein region  51.02 
 
 		 100 aa  102  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0069  DNA polymerase beta domain protein region  52.53 
 
 		 108 aa  101  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0897  HsdR-like, putative type I restriction deoxyribonuclease  48.54 
 
 		 1294 aa  98.2  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0292  DNA polymerase beta subunit  52.53 
 
 		 108 aa  97.8  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0095  DNA polymerase beta subunit  44 
 
 		 112 aa  92  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.365343 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1674  DNA polymerase, beta-like region  43.75 
 
 		 105 aa  85.5  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.538651  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1207  DNA polymerase beta subunit  43.56 
 
 		 105 aa  85.9  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.901472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0491  hypothetical protein  37.76 
 
 		 112 aa  78.6  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.484621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1691  DNA polymerase beta domain protein region  38.2 
 
 		 95 aa  73.6  0.0000000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0339005 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0594  hypothetical protein  34.91 
 
 		 102 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1656  DNA polymerase beta domain protein region  49.49 
 
 		 103 aa  72.8  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0769  DNA polymerase beta domain protein region  32.67 
 
 		 106 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0754  DNA polymerase beta domain protein region  33.96 
 
 		 106 aa  68.2  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.923157  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0763  DNA polymerase beta domain protein region  28 
 
 		 111 aa  61.2  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.667533  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2573  DNA polymerase beta domain protein region  27.37 
 
 		 97 aa  54.3  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0668582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1038  DNA polymerase beta subunit  27.55 
 
 		 118 aa  53.5  0.0000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0191145  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1560  DNA polymerase beta domain protein region  31.96 
 
 		 105 aa  51.6  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0806  nucleotidyltransferase substrate binding protein, HI0074 family  34.31 
 
 		 247 aa  51.6  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0051  DNA polymerase beta subunit  30.11 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0498801  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1381  DNA polymerase beta domain protein region  31.07 
 
 		 97 aa  47  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0295  DNA polymerase beta domain protein region  30.69 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0284  DNA polymerase beta domain protein region  31 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0270  nucleotidyltransferase domain-containing protein  30.91 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.440685  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4507  DNA polymerase beta subunit  24.72 
 
 		 103 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.152779 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4035  DNA polymerase beta subunit  34.29 
 
 		 103 aa  44.7  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4093  DNA polymerase beta subunit  29.17 
 
 		 144 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.792908  normal  0.694143 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0268  DNA polymerase beta domain protein region  30.53 
 
 		 100 aa  42  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3062  DNA polymerase beta domain protein region  25.41 
 
 		 189 aa  41.2  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0502  DNA polymerase beta domain protein region  29.55 
 
 		 124 aa  40.4  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0545  DNA polymerase beta subunit  44.9 
 
 		 128 aa  40  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00745715  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0347  DNA polymerase beta domain protein region  30.21 
 
 		 102 aa  40  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>